135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2553 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2553  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  434  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2500  hypothetical protein  83.49 
 
 		 212 aa  368  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.487366  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00182  hypothetical protein  38.21 
 
 		 208 aa  141  6e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.448244  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1442  hypothetical protein  37.26 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  31.46 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  25.69 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  26.54 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0784272 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2657  hypothetical protein  29.05 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  29.95 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0643  phosphate transport regulator  25.24 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.233591  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1312  hypothetical protein  29.95 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  27.57 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1122  hypothetical protein  28.38 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000112514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2001  hypothetical protein  28.04 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  29.44 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  29.44 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1248  protein of unknown function DUF47  30.23 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1187  protein of unknown function DUF47  30.23 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0873064  normal  0.0562102 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  26.82 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3016  hypothetical protein  24.88 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.25831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  26.82 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  29.17 
 
 		 205 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0916  hypothetical protein  27.1 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  26.51 
 
 		 208 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1151  hypothetical protein  24.88 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  28.5 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  24.31 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  24.88 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  26.24 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2396  inorganic phosphate transporter  25.12 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.333431  normal  0.154826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1791  protein of unknown function DUF47  25.12 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0557964 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5169  hypothetical protein  27.49 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3394  hypothetical protein  26.05 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2577  hypothetical protein  25.35 
 
 		 214 aa  72  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2184  hypothetical protein  26.54 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1399  hypothetical protein  25.24 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2411  hypothetical protein  25.24 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644101  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1806  hypothetical protein  27.01 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49421  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1889  hypothetical protein  25.24 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0007  hypothetical protein  25.24 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582837  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2246  hypothetical protein  25.24 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0649417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2285  hypothetical protein  25.24 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1162  hypothetical protein  25.24 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0191  protein of unknown function DUF47  29.86 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1778  hypothetical protein  27.01 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  25.79 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1405  hypothetical protein  26.54 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2678  protein of unknown function DUF47  29.58 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.509665 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  24.29 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6210  hypothetical protein  25.82 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528851  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1869  hypothetical protein  25.82 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2118  protein of unknown function DUF47  29.3 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140894  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1892  hypothetical protein  25.82 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000497448  hitchhiker  0.00000000694622 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2384  protein of unknown function DUF47  25.33 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0677  hypothetical protein  26.24 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  26.03 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  27.62 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0558  protein of unknown function DUF47  22.94 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  23.81 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  23.81 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1484  protein of unknown function DUF47  27.7 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000548446  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2877  protein of unknown function DUF47  24.42 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0461875  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2716  protein of unknown function DUF47  23.79 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3001  hypothetical protein  21.18 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000863551  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1405  hypothetical protein  26.53 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3022  Putative phosphate transport regulator  22.64 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  25.98 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  24.88 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0716  hypothetical protein  22.58 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1647  hypothetical protein  24.39 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0593  hypothetical protein  23.72 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5473  protein of unknown function DUF47  23 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.400135 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33550  phosphate transport regulator related to PhoU  27.23 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.108249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  26.42 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5203  protein of unknown function DUF47  23.47 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177281 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8017  protein of unknown function DUF47  27.06 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.938753  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  22.75 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2818  Putitive phosphate transport regulator  26.42 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  24.4 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1022  hypothetical protein  22.61 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.808051 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0562  hypothetical protein  23.08 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0299  protein of unknown function DUF47  26.17 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.686471  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  26.34 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0548  hypothetical protein  23.08 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  23.92 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0763  hypothetical protein  25.49 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.615042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4359  protein of unknown function DUF47  25.6 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.547523  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  26.36 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2627  Putitive phosphate transport regulator  26.67 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0386  protein of unknown function DUF47  25.79 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1509  hypothetical protein  22.71 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0044058  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0997  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  22.38 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3197  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  24.29 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0687  hypothetical protein  26.17 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00131316  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0702  hypothetical protein  26.17 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000282132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1179  hypothetical protein  22.71 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000750489  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1377  hypothetical protein  22.71 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000152766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3836  hypothetical protein  22.71 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.103602  hitchhiker  0.0000000000851308 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1362  hypothetical protein  23.08 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000180581  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  22.94 
 
 		 390 aa  53.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113159 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>