27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1133 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1133  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  394  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.620047  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3949  hypothetical protein  39.91 
 
 
234 aa  138  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0888  hypothetical protein  39.91 
 
 
227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286544  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4091  hypothetical protein  37.56 
 
 
227 aa  128  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1415  hypothetical protein  39.38 
 
 
228 aa  127  9.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4049  hypothetical protein  41.07 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649673  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1460  hypothetical protein  38.94 
 
 
228 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165878  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1713  hypothetical protein  38.5 
 
 
228 aa  123  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0296  protein of unknown function DUF1498  37.09 
 
 
223 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.334779  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0372  hypothetical protein  39.73 
 
 
221 aa  119  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2025  conserved hypothetical protein DUF1498  39.29 
 
 
230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0403362 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0286  hypothetical protein  36.61 
 
 
228 aa  116  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0607259 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3303  hypothetical protein  36.16 
 
 
227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.098121 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4027  hypothetical protein  35.71 
 
 
227 aa  111  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1279  hypothetical protein  34.55 
 
 
235 aa  111  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.394423 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0128  hypothetical protein  35.71 
 
 
227 aa  111  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5598  hypothetical protein  34.96 
 
 
227 aa  111  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.918014  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4099  hypothetical protein  35.71 
 
 
227 aa  111  7.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3991  hypothetical protein  40 
 
 
226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1032  hypothetical protein  34.08 
 
 
228 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.197689 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2521  hypothetical protein  35.65 
 
 
223 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000015682  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2386  hypothetical protein  30.65 
 
 
181 aa  65.1  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756846  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2534  hypothetical protein  30.65 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.945673  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0320  YdaE  29.41 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0343325  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0707  YdaE  31.38 
 
 
181 aa  62.8  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2281  YdaE  29.8 
 
 
174 aa  57.4  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0955109  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2878  N-acetylneuraminic acid synthase domain protein  29.71 
 
 
497 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.251215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>