11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2281 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2281  YdaE  100 
 
 
174 aa  362  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0955109  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2534  hypothetical protein  52.69 
 
 
181 aa  192  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.945673  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2386  hypothetical protein  52.1 
 
 
181 aa  190  9e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756846  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0320  YdaE  48.57 
 
 
181 aa  177  8e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0343325  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0707  YdaE  48.75 
 
 
181 aa  170  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1133  hypothetical protein  29.8 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.620047  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2878  N-acetylneuraminic acid synthase domain protein  28.24 
 
 
497 aa  56.6  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.251215  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3949  hypothetical protein  25.77 
 
 
234 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3303  hypothetical protein  25.31 
 
 
227 aa  42.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.098121 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2025  conserved hypothetical protein DUF1498  27.67 
 
 
230 aa  42.4  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0403362 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0296  protein of unknown function DUF1498  25.6 
 
 
223 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.334779  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>