13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0707 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0707  YdaE  100 
 
 
181 aa  373  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2534  hypothetical protein  63.33 
 
 
181 aa  243  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.945673  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2386  hypothetical protein  62.78 
 
 
181 aa  241  3.9999999999999997e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756846  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0320  YdaE  58.1 
 
 
181 aa  224  7e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0343325  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2281  YdaE  48.75 
 
 
174 aa  170  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0955109  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1133  hypothetical protein  31.38 
 
 
190 aa  62.8  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.620047  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2025  conserved hypothetical protein DUF1498  32.46 
 
 
230 aa  54.3  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0403362 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0372  hypothetical protein  29.76 
 
 
221 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2878  N-acetylneuraminic acid synthase domain protein  30.82 
 
 
497 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.251215  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3949  hypothetical protein  28.73 
 
 
234 aa  48.5  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0296  protein of unknown function DUF1498  27.85 
 
 
223 aa  48.5  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.334779  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1279  hypothetical protein  27.88 
 
 
235 aa  46.6  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.394423 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3303  hypothetical protein  25.15 
 
 
227 aa  44.3  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.098121 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>