14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2386 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2386  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  373  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756846  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2534  hypothetical protein  99.45 
 
 
181 aa  372  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.945673  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0707  YdaE  62.78 
 
 
181 aa  241  3.9999999999999997e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0320  YdaE  61.71 
 
 
181 aa  232  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0343325  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2281  YdaE  52.1 
 
 
174 aa  190  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0955109  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1133  hypothetical protein  30.65 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.620047  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2878  N-acetylneuraminic acid synthase domain protein  36.96 
 
 
497 aa  50.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.251215  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3949  hypothetical protein  26.6 
 
 
234 aa  47  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0372  hypothetical protein  25 
 
 
221 aa  42.4  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2521  hypothetical protein  27.01 
 
 
223 aa  42  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000015682  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4091  hypothetical protein  27.78 
 
 
227 aa  42  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3303  hypothetical protein  24.4 
 
 
227 aa  41.6  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.098121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0296  protein of unknown function DUF1498  27.33 
 
 
223 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.334779  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2025  conserved hypothetical protein DUF1498  27.67 
 
 
230 aa  41.2  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0403362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>