24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0372 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0372  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  455  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1713  hypothetical protein  66.07 
 
 		 228 aa  298  6e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1415  hypothetical protein  66.07 
 
 		 228 aa  297  7e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1460  hypothetical protein  65.62 
 
 		 228 aa  296  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165878  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2025  conserved hypothetical protein DUF1498  64.13 
 
 		 230 aa  285  5e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0403362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3949  hypothetical protein  63.68 
 
 		 234 aa  281  4.0000000000000003e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3303  hypothetical protein  63.39 
 
 		 227 aa  280  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.098121 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4049  hypothetical protein  61.99 
 
 		 226 aa  277  8e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4091  hypothetical protein  50.67 
 
 		 227 aa  220  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1279  hypothetical protein  49.78 
 
 		 235 aa  214  8e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.394423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0888  hypothetical protein  48.88 
 
 		 227 aa  212  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286544  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2521  hypothetical protein  50.22 
 
 		 223 aa  209  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000015682  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1032  hypothetical protein  49.12 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.197689 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5598  hypothetical protein  44.69 
 
 		 227 aa  184  8e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.918014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4027  hypothetical protein  46.46 
 
 		 227 aa  181  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0128  hypothetical protein  46.46 
 
 		 227 aa  181  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4099  hypothetical protein  46.46 
 
 		 227 aa  181  8.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0286  hypothetical protein  45.58 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0607259 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0296  protein of unknown function DUF1498  47.47 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.334779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3991  hypothetical protein  39.73 
 
 		 226 aa  158  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1133  hypothetical protein  39.73 
 
 		 190 aa  119  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.620047  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0707  YdaE  29.76 
 
 		 181 aa  50.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2534  hypothetical protein  26.22 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.945673  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2386  hypothetical protein  25 
 
 		 181 aa  42.4  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>