21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1032 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1032  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  477  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.197689 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0128  hypothetical protein  72.25 
 
 
227 aa  352  4e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4099  hypothetical protein  72.25 
 
 
227 aa  351  4e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4027  hypothetical protein  72.25 
 
 
227 aa  352  4e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5598  hypothetical protein  72.12 
 
 
227 aa  349  3e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.918014  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0286  hypothetical protein  71.68 
 
 
228 aa  347  1e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0607259 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4091  hypothetical protein  54.39 
 
 
227 aa  239  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2521  hypothetical protein  53.57 
 
 
223 aa  231  6e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000015682  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0888  hypothetical protein  53.33 
 
 
227 aa  229  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286544  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3991  hypothetical protein  49.11 
 
 
226 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3949  hypothetical protein  48.9 
 
 
234 aa  205  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1415  hypothetical protein  46.96 
 
 
228 aa  201  7e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1713  hypothetical protein  46.52 
 
 
228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1460  hypothetical protein  46.52 
 
 
228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165878  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0372  hypothetical protein  49.12 
 
 
221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2025  conserved hypothetical protein DUF1498  47.58 
 
 
230 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0403362 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1279  hypothetical protein  47.6 
 
 
235 aa  193  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.394423 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3303  hypothetical protein  42.92 
 
 
227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.098121 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4049  hypothetical protein  42.92 
 
 
226 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649673  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0296  protein of unknown function DUF1498  43.38 
 
 
223 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.334779  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1133  hypothetical protein  34.08 
 
 
190 aa  105  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.620047  normal  0.202309 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>