25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0296 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0296  protein of unknown function DUF1498  100 
 
 
223 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.334779  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2521  hypothetical protein  45.62 
 
 
223 aa  192  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000015682  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4091  hypothetical protein  47.69 
 
 
227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0128  hypothetical protein  46.85 
 
 
227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0286  hypothetical protein  47.79 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0607259 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4099  hypothetical protein  46.85 
 
 
227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4027  hypothetical protein  46.85 
 
 
227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2025  conserved hypothetical protein DUF1498  48.23 
 
 
230 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0403362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3949  hypothetical protein  43.24 
 
 
234 aa  177  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3303  hypothetical protein  42.99 
 
 
227 aa  176  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.098121 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1713  hypothetical protein  44.59 
 
 
228 aa  176  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0888  hypothetical protein  45.12 
 
 
227 aa  175  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286544  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1279  hypothetical protein  45.25 
 
 
235 aa  174  8e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.394423 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1415  hypothetical protein  44.59 
 
 
228 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5598  hypothetical protein  44.25 
 
 
227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.918014  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1460  hypothetical protein  44.14 
 
 
228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165878  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0372  hypothetical protein  47.47 
 
 
221 aa  170  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4049  hypothetical protein  43.89 
 
 
226 aa  168  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649673  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1032  hypothetical protein  43.38 
 
 
228 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.197689 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3991  hypothetical protein  42.79 
 
 
226 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1133  hypothetical protein  37.09 
 
 
190 aa  119  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.620047  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0707  YdaE  27.85 
 
 
181 aa  48.5  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2534  hypothetical protein  27.95 
 
 
181 aa  42.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.945673  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2281  YdaE  25.6 
 
 
174 aa  42  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0955109  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2386  hypothetical protein  27.33 
 
 
181 aa  41.6  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>