21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A4099 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A4099  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  478  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0128  hypothetical protein  99.56 
 
 
227 aa  475  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4027  hypothetical protein  99.56 
 
 
227 aa  475  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0286  hypothetical protein  74.34 
 
 
228 aa  367  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0607259 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5598  hypothetical protein  73.45 
 
 
227 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.918014  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1032  hypothetical protein  72.25 
 
 
228 aa  351  4e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.197689 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4091  hypothetical protein  53.74 
 
 
227 aa  234  8e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2521  hypothetical protein  52.42 
 
 
223 aa  221  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000015682  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3991  hypothetical protein  47.77 
 
 
226 aa  214  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0888  hypothetical protein  48.66 
 
 
227 aa  211  7.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286544  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2025  conserved hypothetical protein DUF1498  46.7 
 
 
230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0403362 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1713  hypothetical protein  44.78 
 
 
228 aa  191  9e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1415  hypothetical protein  45.26 
 
 
228 aa  190  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1460  hypothetical protein  44.83 
 
 
228 aa  188  5e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165878  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0296  protein of unknown function DUF1498  46.85 
 
 
223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.334779  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1279  hypothetical protein  45.61 
 
 
235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.394423 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3949  hypothetical protein  43.48 
 
 
234 aa  181  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0372  hypothetical protein  46.46 
 
 
221 aa  181  8.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3303  hypothetical protein  42.29 
 
 
227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.098121 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4049  hypothetical protein  41.59 
 
 
226 aa  167  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649673  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1133  hypothetical protein  35.71 
 
 
190 aa  111  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.620047  normal  0.202309 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>