21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4049 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4049  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  462  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2025  conserved hypothetical protein DUF1498  68.61 
 
 		 230 aa  294  6e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0403362 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3303  hypothetical protein  66.82 
 
 		 227 aa  293  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.098121 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0372  hypothetical protein  61.99 
 
 		 221 aa  277  8e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3949  hypothetical protein  60.99 
 
 		 234 aa  272  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1713  hypothetical protein  59.73 
 
 		 228 aa  271  5.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1415  hypothetical protein  59.29 
 
 		 228 aa  271  7e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1460  hypothetical protein  58.85 
 
 		 228 aa  270  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165878  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0888  hypothetical protein  53.57 
 
 		 227 aa  223  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286544  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4091  hypothetical protein  51.34 
 
 		 227 aa  221  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1279  hypothetical protein  51.12 
 
 		 235 aa  220  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.394423 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2521  hypothetical protein  46.64 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000015682  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1032  hypothetical protein  42.92 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.197689 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0296  protein of unknown function DUF1498  43.89 
 
 		 223 aa  168  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.334779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4099  hypothetical protein  41.59 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4027  hypothetical protein  41.59 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0128  hypothetical protein  41.59 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5598  hypothetical protein  41.74 
 
 		 227 aa  165  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.918014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0286  hypothetical protein  41.59 
 
 		 228 aa  161  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0607259 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3991  hypothetical protein  40.18 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1133  hypothetical protein  41.07 
 
 		 190 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.620047  normal  0.202309 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>