26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3949 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3949  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  473  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1415  hypothetical protein  67.54 
 
 		 228 aa  317  7.999999999999999e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1460  hypothetical protein  67.11 
 
 		 228 aa  316  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165878  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1713  hypothetical protein  66.67 
 
 		 228 aa  313  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3303  hypothetical protein  59.91 
 
 		 227 aa  286  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.098121 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0372  hypothetical protein  63.68 
 
 		 221 aa  281  4.0000000000000003e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2025  conserved hypothetical protein DUF1498  60.35 
 
 		 230 aa  277  9e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0403362 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4049  hypothetical protein  60.99 
 
 		 226 aa  272  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4091  hypothetical protein  51.97 
 
 		 227 aa  245  4e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0888  hypothetical protein  52.91 
 
 		 227 aa  233  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286544  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1279  hypothetical protein  50.44 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.394423 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2521  hypothetical protein  51.95 
 
 		 223 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000015682  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1032  hypothetical protein  48.9 
 
 		 228 aa  205  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.197689 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0286  hypothetical protein  44.69 
 
 		 228 aa  191  8e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0607259 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5598  hypothetical protein  44.78 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.918014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4099  hypothetical protein  43.48 
 
 		 227 aa  181  7e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4027  hypothetical protein  43.48 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0128  hypothetical protein  43.48 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0296  protein of unknown function DUF1498  43.24 
 
 		 223 aa  177  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.334779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3991  hypothetical protein  42.54 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1133  hypothetical protein  39.91 
 
 		 190 aa  138  7.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.620047  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0320  YdaE  28.66 
 
 		 181 aa  50.1  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0343325  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0707  YdaE  28.73 
 
 		 181 aa  48.5  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2386  hypothetical protein  26.6 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756846  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2534  hypothetical protein  26.6 
 
 		 181 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.945673  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2281  YdaE  25.77 
 
 		 174 aa  42.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0955109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>