13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0320 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0320  YdaE  100 
 
 		 181 aa  380  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0343325  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2534  hypothetical protein  62.29 
 
 		 181 aa  233  8e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.945673  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2386  hypothetical protein  61.71 
 
 		 181 aa  232  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756846  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0707  YdaE  58.1 
 
 		 181 aa  224  7e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2281  YdaE  48.57 
 
 		 174 aa  177  8e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0955109  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1133  hypothetical protein  29.41 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.620047  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3949  hypothetical protein  28.66 
 
 		 234 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2025  conserved hypothetical protein DUF1498  29.7 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0403362 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1279  hypothetical protein  27.06 
 
 		 235 aa  46.6  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.394423 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2878  N-acetylneuraminic acid synthase domain protein  27.59 
 
 		 497 aa  44.3  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.251215  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4091  hypothetical protein  31.9 
 
 		 227 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2521  hypothetical protein  25.47 
 
 		 223 aa  42  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000015682  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1415  hypothetical protein  26.67 
 
 		 228 aa  40.8  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>