24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2025 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2025  conserved hypothetical protein DUF1498  100 
 
 		 230 aa  470  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0403362 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3303  hypothetical protein  71.81 
 
 		 227 aa  343  2e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.098121 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1713  hypothetical protein  66.07 
 
 		 228 aa  304  8.000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1415  hypothetical protein  64.29 
 
 		 228 aa  298  7e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1460  hypothetical protein  63.84 
 
 		 228 aa  296  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165878  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4049  hypothetical protein  68.61 
 
 		 226 aa  294  6e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0372  hypothetical protein  64.13 
 
 		 221 aa  285  5e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3949  hypothetical protein  60.35 
 
 		 234 aa  277  9e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4091  hypothetical protein  53.36 
 
 		 227 aa  232  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0888  hypothetical protein  54.26 
 
 		 227 aa  228  8e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286544  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1279  hypothetical protein  46.05 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.394423 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2521  hypothetical protein  49.78 
 
 		 223 aa  201  9e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000015682  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4099  hypothetical protein  46.7 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4027  hypothetical protein  46.7 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0128  hypothetical protein  46.7 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1032  hypothetical protein  47.58 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.197689 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0286  hypothetical protein  45.41 
 
 		 228 aa  188  7e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0607259 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5598  hypothetical protein  45.22 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.918014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0296  protein of unknown function DUF1498  48.23 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.334779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3991  hypothetical protein  41.52 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1133  hypothetical protein  39.29 
 
 		 190 aa  119  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.620047  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0707  YdaE  32.46 
 
 		 181 aa  54.3  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0320  YdaE  29.7 
 
 		 181 aa  46.6  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0343325  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2281  YdaE  27.67 
 
 		 174 aa  42.4  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0955109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>