More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_32237 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009360  OSTLU_32237  predicted protein  100 
 
 
106 aa  218  1.9999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.18416 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_9256  predicted protein  80.26 
 
 
76 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15211  predicted protein  58.44 
 
 
91 aa  88.6  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0493  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  55.56 
 
 
66 aa  80.9  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.156279  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2027  cold shock-like protein CspC  50.77 
 
 
69 aa  78.2  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1920  cold shock-like protein CspC  50.77 
 
 
69 aa  77.8  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000217103  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2822  cold shock-like protein CspC  50.77 
 
 
69 aa  77.8  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000720852  decreased coverage  0.000019593 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_5001  cold shock protein  50.77 
 
 
69 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.56924e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2213  cold shock-like protein CspC  50.77 
 
 
69 aa  77.8  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00000972653  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2474  cold shock-like protein CspC  50.77 
 
 
69 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00166025  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01793  stress protein, member of the CspA-family  50.77 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000145825  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1820  cold-shock DNA-binding domain protein  50.77 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000376643  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01781  hypothetical protein  50.77 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000220518  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1977  cold shock-like protein CspC  50.77 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000786929  normal  0.190727 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1981  cold shock-like protein CspC  50.77 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000173649  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1913  cold shock-like protein CspC  50.77 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000658  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2089  cold shock-like protein CspC  50.77 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.57783e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1294  cold shock-like protein CspC  50.77 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000632959  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1478  cold shock-like protein CspC  50.77 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000112944  normal  0.636634 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1365  cold shock-like protein CspC  50.77 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000234098  normal  0.0150165 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2038  cold shock-like protein CspC  50.77 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000133144  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2554  cold shock-like protein CspC  50.77 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000000810099  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2051  cold shock-like protein CspC  50.77 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000465967  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2393  cold shock-like protein CspC  50.77 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000101532  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1977  cold shock-like protein CspC  48.48 
 
 
69 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1522  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  54.84 
 
 
67 aa  75.9  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4713  cold-shock DNA-binding domain protein  56.45 
 
 
67 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1465  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  54.84 
 
 
67 aa  75.9  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.359616  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1740  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.59 
 
 
70 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183326  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_5000  cold shock protein  45.59 
 
 
70 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1892  cold-shock DNA-binding domain protein  56.25 
 
 
67 aa  75.1  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3052  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.59 
 
 
70 aa  74.7  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3862  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.76 
 
 
70 aa  74.7  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.563148  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0730  cold shock protein CspE  46.97 
 
 
69 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0684  cold shock protein CspE  46.97 
 
 
69 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0788  cold shock protein CspE  46.97 
 
 
69 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0838453  normal  0.873226 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0670  cold shock protein CspE  46.97 
 
 
69 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00211319  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1159  cold shock protein CspE  46.97 
 
 
69 aa  74.3  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0744  cold shock protein CspE  46.97 
 
 
69 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.231158  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1172  cold shock protein CspE  46.97 
 
 
69 aa  74.3  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1440  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50.79 
 
 
67 aa  73.9  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3159  cold shock protein CspE  46.97 
 
 
69 aa  74.3  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000139034  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2963  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.59 
 
 
70 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.711924 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1947  Cold-shock protein DNA-binding  52.31 
 
 
68 aa  73.9  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.711231  hitchhiker  0.00117492 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2904  cold-shock DNA-binding protein family protein  52.17 
 
 
71 aa  73.9  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0532076  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5230  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  51.56 
 
 
67 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244858  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2958  cold shock protein CspE  46.15 
 
 
69 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0282333  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3031  cold shock protein CspE  46.15 
 
 
69 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.036334  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1083  cold-shock DNA-binding domain protein  46.15 
 
 
69 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1250  cold-shock DNA-binding protein family protein  52.17 
 
 
71 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.124236  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1858  cold shock protein CspE  46.15 
 
 
69 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.32354 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00593  cold shock protein E  46.15 
 
 
69 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0712  cold shock protein CspE  46.15 
 
 
69 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0018015  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3002  cold-shock DNA-binding domain protein  46.15 
 
 
69 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0574427  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0375  cold shock DNA-binding domain-containing protein  47.76 
 
 
70 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12737  predicted protein  58.49 
 
 
71 aa  72.4  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0221  cold-shock DNA-binding domain protein  44.93 
 
 
70 aa  72  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0538  cold shock protein CspE  46.15 
 
 
69 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0644  cold shock protein CspE  46.15 
 
 
69 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0784428  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1189  cold shock protein CspE  46.15 
 
 
69 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0675  cold shock protein CspE  46.15 
 
 
69 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000392249  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0648  cold shock protein CspE  46.15 
 
 
69 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00594526  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00582  hypothetical protein  46.15 
 
 
69 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3021  cold shock protein CspE  46.15 
 
 
69 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0130834  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0172  cold-shock DNA-binding domain protein  50 
 
 
67 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000163048  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0201  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.27 
 
 
70 aa  72.8  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.766684  hitchhiker  0.00947065 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3605  putative cold-shock DNA-binding domain protein  51.56 
 
 
67 aa  71.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2974  cold shock protein CspE  46.15 
 
 
69 aa  72  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0637761  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2498  cold-shock DNA-binding protein family protein  44.12 
 
 
70 aa  71.6  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000241121  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00992  DNA-binding transcriptional regulator  47.06 
 
 
70 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2653  cold-shock DNA-binding domain protein  47.06 
 
 
70 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000496106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1105  cold shock protein CspG  47.06 
 
 
70 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000233553  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00999  hypothetical protein  47.06 
 
 
70 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2607  cold shock protein CspG  47.06 
 
 
70 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286712  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1225  cold shock protein CspG  47.06 
 
 
70 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000203795  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2135  cold shock protein CspG  47.06 
 
 
70 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0472  cold-shock DNA-binding protein family protein  50.79 
 
 
67 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16014  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5002  cold-shock DNA-binding domain protein  55.56 
 
 
67 aa  71.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0802588  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2326  cold shock protein CspG  47.06 
 
 
70 aa  71.2  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000227415  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1099  cold shock protein CspG  47.06 
 
 
70 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0641  cold-shock DNA-binding domain protein  50.79 
 
 
67 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2053  cold-shock DNA-binding domain protein  48.44 
 
 
67 aa  71.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.203977  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1765  cold shock DNA-binding protein  45.07 
 
 
71 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0225255  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1715  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.97 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0270  cold-shock DNA-binding domain protein  58.82 
 
 
67 aa  70.5  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1251  cold-shock DNA-binding domain protein  50.79 
 
 
67 aa  70.5  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.791861  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4798  cold-shock DNA-binding protein family protein  51.61 
 
 
67 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4884  cold-shock DNA-binding protein family protein  51.61 
 
 
67 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.71911  normal  0.101787 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5398  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  51.61 
 
 
67 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.262283  normal  0.0908383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5184  cold-shock DNA-binding protein family protein  51.61 
 
 
67 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427326 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1392  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  51.61 
 
 
67 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.124556  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4023  cold-shock DNA-binding domain protein  49.21 
 
 
67 aa  70.5  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477592 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02480  cold-shock DNA-binding protein family  49.21 
 
 
67 aa  70.5  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181166  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0261  cold shock protein CspE  44.62 
 
 
69 aa  70.5  0.000000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2376  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.83 
 
 
84 aa  70.5  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000357457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1131  cold-shock DNA-binding domain protein  47.62 
 
 
67 aa  70.5  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.294478 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3948  cold-shock DNA-binding domain protein  51.56 
 
 
67 aa  70.1  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3141  cold-shock DNA-binding domain protein  51.61 
 
 
67 aa  70.1  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0244532  hitchhiker  0.00153434 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1220  cold shock DNA-binding domain-containing protein  46.27 
 
 
70 aa  70.1  0.000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0444  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.27 
 
 
70 aa  70.1  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>