More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4713 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4713  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 		 67 aa  139  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1892  cold-shock DNA-binding domain protein  80.6 
 
 		 67 aa  116  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5002  cold-shock DNA-binding domain protein  82.09 
 
 		 67 aa  113  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0802588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3948  cold-shock DNA-binding domain protein  73.13 
 
 		 67 aa  107  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1131  cold-shock DNA-binding domain protein  62.69 
 
 		 67 aa  97.4  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.294478 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1055  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.69 
 
 		 67 aa  97.1  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.481948  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1522  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.69 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1465  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.69 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.359616  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0175  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.18 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0927  cold-shock protein, DNA-binding  64.62 
 
 		 70 aa  93.6  8e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650584  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1896  cold-shock DNA-binding domain protein  61.19 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385975  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0290  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.69 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0735  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.08 
 
 		 70 aa  92.4  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5230  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.19 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01731  hypothetical protein  59.7 
 
 		 68 aa  92  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1049  cold-shock DNA-binding domain protein  62.69 
 
 		 67 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0988  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.69 
 
 		 67 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1045  cold-shock DNA-binding domain protein  62.69 
 
 		 67 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.396466  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2965  cold-shock DNA-binding domain protein  60 
 
 		 68 aa  90.1  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000138264 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1648  cold shock domain-contain protein  61.54 
 
 		 69 aa  89.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3093  cold-shock DNA-binding protein family protein  59.09 
 
 		 72 aa  89  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.475725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1034  cold shock-like protein CspG  62.5 
 
 		 69 aa  88.6  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02738  putative Cold shock-like protein  61.29 
 
 		 70 aa  88.6  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161159  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4042  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.7 
 
 		 67 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0172  cold-shock DNA-binding domain protein  59.09 
 
 		 67 aa  88.6  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000163048  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4023  cold-shock DNA-binding domain protein  59.7 
 
 		 67 aa  88.2  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477592 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1053  cold shock-like transcription regulator protein  59.09 
 
 		 67 aa  88.6  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.470883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3261  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.61 
 
 		 69 aa  88.2  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3292  cold-shock DNA-binding domain protein  61.19 
 
 		 67 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0070619  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3366  cold-shock DNA-binding domain protein  61.19 
 
 		 67 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4386  cold-shock DNA-binding domain protein  62.5 
 
 		 67 aa  87.8  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4276  cold-shock DNA-binding domain protein  62.5 
 
 		 67 aa  87.8  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2676  cold-shock DNA-binding protein family protein  58.21 
 
 		 67 aa  88.2  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000256327  unclonable  1.4308e-18 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1251  cold-shock DNA-binding domain protein  62.5 
 
 		 67 aa  87.8  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.791861  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4932  major cold shock protein  61.54 
 
 		 70 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.859989 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03357  hypothetical protein  61.54 
 
 		 70 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03406  major cold shock protein  61.54 
 
 		 70 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0156  cold-shock DNA-binding domain protein  61.54 
 
 		 70 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4033  major cold shock protein  61.54 
 
 		 70 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.661127  normal  0.575238 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3929  major cold shock protein  61.54 
 
 		 70 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3970  major cold shock protein  61.54 
 
 		 70 aa  87.4  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1112  cold shock transcription regulator protein  59.09 
 
 		 81 aa  87.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000170415  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0160  major cold shock protein  61.54 
 
 		 70 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4117  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  58.21 
 
 		 67 aa  87.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.327381  normal  0.21845 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3877  major cold shock protein  61.54 
 
 		 70 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.76351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2246  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.58 
 
 		 67 aa  87.4  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000157436  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4052  major cold shock protein  61.54 
 
 		 70 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0761  cold-shock domain-contain protein  59.09 
 
 		 81 aa  87.4  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.00000000000025188  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3973  major cold shock protein  61.54 
 
 		 70 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3757  major cold shock protein  61.54 
 
 		 70 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3864  major cold shock protein  61.54 
 
 		 70 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2622  cold-shock DNA-binding protein family protein  60 
 
 		 69 aa  87.4  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345453 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2689  cold-shock DNA-binding protein family protein  60 
 
 		 69 aa  87.4  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3845  major cold shock protein  61.54 
 
 		 70 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.644384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2963  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  56.92 
 
 		 70 aa  87.8  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.711924 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0641  cold-shock DNA-binding domain protein  59.7 
 
 		 67 aa  87.8  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1366  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60 
 
 		 69 aa  87.4  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1464  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60 
 
 		 69 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1500  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60 
 
 		 69 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2279  cold-shock domain-contain protein  59.09 
 
 		 67 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000000750079  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2156  cold-shock domain-contain protein  59.09 
 
 		 67 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000351487  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5134  cold-shock DNA-binding protein family protein  56.72 
 
 		 67 aa  87  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.984065  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2438  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.09 
 
 		 67 aa  87  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.00000000000180609  unclonable  0.0000000000176576 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0958  cold shock protein  59.09 
 
 		 67 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.000000000000117939  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1257  putative cold shock-like protein  60.61 
 
 		 70 aa  87.4  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.143325 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0962  cold shock protein  59.09 
 
 		 67 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000153995  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0775  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.09 
 
 		 67 aa  87  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150831  hitchhiker  0.000000000149768 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2568  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.09 
 
 		 67 aa  87  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000063088  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1358  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.09 
 
 		 70 aa  87.4  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1051  cold-shock domain-contain protein  59.09 
 
 		 67 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117316  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2883  cold-shock DNA-binding domain protein  60 
 
 		 69 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808952 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0574  cold-shock domain-contain protein  59.09 
 
 		 67 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000358394  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5929  putative cold-shock DNA-binding domain protein  58.21 
 
 		 67 aa  87  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0156128 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0472  cold-shock DNA-binding protein family protein  58.21 
 
 		 67 aa  86.7  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16014  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0507  cold-shock DNA-binding domain protein  55.38 
 
 		 67 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.804223  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0567  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.58 
 
 		 68 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000101913  hitchhiker  0.000143899 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2545  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.09 
 
 		 67 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000242015  decreased coverage  0.000000000715587 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5852  cold-shock DNA-binding protein family protein  59.09 
 
 		 67 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000587256  normal  0.480668 
 
 
 
NC_013530  Xcel_0103  cold-shock DNA-binding domain protein  53.73 
 
 		 67 aa  86.7  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3176  cold-shock DNA-binding protein family protein  58.21 
 
 		 67 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3141  cold-shock DNA-binding domain protein  56.92 
 
 		 67 aa  86.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0244532  hitchhiker  0.00153434 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0798  cold-shock DNA-binding protein family protein  57.58 
 
 		 68 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000106482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2061  cold-shock DNA-binding protein family protein  56.72 
 
 		 67 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.131927 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1909  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.09 
 
 		 67 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000083542  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2202  cold-shock DNA-binding domain protein  56.72 
 
 		 67 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3167  cold-shock DNA-binding domain protein  57.58 
 
 		 68 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493488  hitchhiker  0.00220171 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2520  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.09 
 
 		 67 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.000000000000151269  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1189  cold shock protein CspE  57.81 
 
 		 69 aa  86.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1040  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  56.72 
 
 		 67 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1388  cold-shock DNA-binding protein family protein  56.72 
 
 		 67 aa  85.9  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000202704  normal  0.239262 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0493  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  56.25 
 
 		 66 aa  85.9  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.156279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5581  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  58.21 
 
 		 67 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2053  cold-shock DNA-binding domain protein  57.58 
 
 		 67 aa  85.5  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.203977  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3637  putative cold-shock DNA-binding domain protein  56.72 
 
 		 67 aa  85.9  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1469  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60 
 
 		 69 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5798  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  58.21 
 
 		 67 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.992183 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5764  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.94 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008002 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0166  major cold shock protein  60 
 
 		 70 aa  85.1  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0855  cold-shock DNA-binding protein family protein  57.81 
 
 		 68 aa  85.1  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.563444  normal  0.445485 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3159  cold shock protein CspE  56.25 
 
 		 69 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000139034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>