More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5002 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5002  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 		 67 aa  139  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0802588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3948  cold-shock DNA-binding domain protein  79.1 
 
 		 67 aa  115  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4713  cold-shock DNA-binding domain protein  82.09 
 
 		 67 aa  113  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1892  cold-shock DNA-binding domain protein  79.1 
 
 		 67 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1131  cold-shock DNA-binding domain protein  62.69 
 
 		 67 aa  98.2  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.294478 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1055  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.69 
 
 		 67 aa  98.2  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.481948  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0175  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.69 
 
 		 67 aa  93.6  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1251  cold-shock DNA-binding domain protein  63.64 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.791861  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0290  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.06 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2140  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.12 
 
 		 67 aa  91.7  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000648799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4023  cold-shock DNA-binding domain protein  61.19 
 
 		 67 aa  90.5  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477592 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0988  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.19 
 
 		 67 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1045  cold-shock DNA-binding domain protein  61.19 
 
 		 67 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.396466  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1049  cold-shock DNA-binding domain protein  61.19 
 
 		 67 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0172  cold-shock DNA-binding domain protein  62.5 
 
 		 67 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000163048  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0641  cold-shock DNA-binding domain protein  59.7 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3093  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.54 
 
 		 72 aa  89  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.475725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1465  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.19 
 
 		 67 aa  89.4  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.359616  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1522  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.19 
 
 		 67 aa  89.4  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3292  cold-shock DNA-binding domain protein  63.08 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0070619  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3366  cold-shock DNA-binding domain protein  61.19 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1274  cold-shock DNA-binding protein family protein  56.92 
 
 		 67 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03487  putative cold shock-like protein cspG  59.09 
 
 		 69 aa  88.6  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2681  cold-shock DNA-binding domain protein  56.92 
 
 		 67 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114675  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2588  cold-shock DNA-binding domain protein  56.92 
 
 		 67 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.110334  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2246  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60 
 
 		 67 aa  88.2  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000157436  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0472  cold-shock DNA-binding protein family protein  58.21 
 
 		 67 aa  87.8  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16014  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0160  major cold shock protein  64.62 
 
 		 70 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03406  major cold shock protein  64.62 
 
 		 70 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0156  cold-shock DNA-binding domain protein  64.62 
 
 		 70 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3970  major cold shock protein  64.62 
 
 		 70 aa  87.8  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3864  major cold shock protein  64.62 
 
 		 70 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03357  hypothetical protein  64.62 
 
 		 70 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1388  cold-shock DNA-binding protein family protein  59.7 
 
 		 67 aa  87.8  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000202704  normal  0.239262 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3973  major cold shock protein  64.62 
 
 		 70 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4117  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60 
 
 		 67 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.327381  normal  0.21845 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0855  cold-shock DNA-binding protein family protein  60 
 
 		 68 aa  87.8  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.563444  normal  0.445485 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4033  major cold shock protein  64.62 
 
 		 70 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.661127  normal  0.575238 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3757  major cold shock protein  64.62 
 
 		 70 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4052  major cold shock protein  64.62 
 
 		 70 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0252  cold-shock DNA-binding protein family protein  58.21 
 
 		 67 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.994476  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3929  major cold shock protein  64.62 
 
 		 70 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3877  major cold shock protein  64.62 
 
 		 70 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.76351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4932  major cold shock protein  64.62 
 
 		 70 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.859989 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3845  major cold shock protein  64.62 
 
 		 70 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.644384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0262  cold-shock DNA-binding domain protein  58.21 
 
 		 67 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0273  cold-shock DNA-binding domain protein  58.21 
 
 		 67 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5230  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.7 
 
 		 67 aa  87  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0103  cold-shock DNA-binding domain protein  52.24 
 
 		 67 aa  87  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1648  cold shock domain-contain protein  61.29 
 
 		 69 aa  87  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3176  cold-shock DNA-binding protein family protein  60 
 
 		 67 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5134  cold-shock DNA-binding protein family protein  56.72 
 
 		 67 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.984065  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0567  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  58.46 
 
 		 68 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000101913  hitchhiker  0.000143899 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4276  cold-shock DNA-binding domain protein  62.5 
 
 		 67 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4386  cold-shock DNA-binding domain protein  62.5 
 
 		 67 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7382  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  58.21 
 
 		 67 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5852  cold-shock DNA-binding protein family protein  58.46 
 
 		 67 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000587256  normal  0.480668 
 
 
 
NC_009675  Anae109_4042  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  58.46 
 
 		 67 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0927  cold-shock protein, DNA-binding  58.46 
 
 		 70 aa  85.9  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650584  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0166  major cold shock protein  63.08 
 
 		 70 aa  85.9  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2545  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  58.46 
 
 		 67 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000242015  decreased coverage  0.000000000715587 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1909  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  58.46 
 
 		 67 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000083542  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2622  cold-shock DNA-binding protein family protein  59.68 
 
 		 69 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345453 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2689  cold-shock DNA-binding protein family protein  59.68 
 
 		 69 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0735  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.29 
 
 		 70 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2520  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  58.46 
 
 		 67 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.000000000000151269  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0733  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  58.21 
 
 		 67 aa  85.5  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000585148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1464  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.68 
 
 		 69 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5169  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  58.46 
 
 		 67 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02480  cold-shock DNA-binding protein family  56.72 
 
 		 67 aa  85.1  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0273  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.58 
 
 		 67 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.355642 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0668  cold-shock DNA-binding domain protein  52.24 
 
 		 67 aa  85.1  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2883  cold-shock DNA-binding domain protein  59.68 
 
 		 69 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808952 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1500  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.68 
 
 		 69 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3214  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  55.22 
 
 		 67 aa  85.1  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0979697  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1053  cold shock-like transcription regulator protein  56.92 
 
 		 67 aa  84.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.470883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5764  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.38 
 
 		 170 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008002 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0798  cold-shock DNA-binding protein family protein  56.92 
 
 		 68 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000106482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2951  cold-shock DNA-binding protein family protein  56.92 
 
 		 77 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.15288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3167  cold-shock DNA-binding domain protein  56.92 
 
 		 68 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493488  hitchhiker  0.00220171 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6907  cold-shock DNA-binding domain protein  56.92 
 
 		 67 aa  84  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240211  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0679  cold-shock DNA-binding protein family protein  53.73 
 
 		 68 aa  84  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.233328  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1469  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.68 
 
 		 69 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C47  cold-shock DNA-binding protein family protein  59.38 
 
 		 66 aa  83.6  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5227  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  55.22 
 
 		 67 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.54507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1112  cold shock transcription regulator protein  56.92 
 
 		 81 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000170415  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1291  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  56.92 
 
 		 67 aa  83.6  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.515471  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0761  cold-shock domain-contain protein  56.92 
 
 		 81 aa  83.6  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.00000000000025188  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5095  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.38 
 
 		 67 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2279  cold-shock domain-contain protein  56.92 
 
 		 67 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000000750079  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0775  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  56.92 
 
 		 67 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150831  hitchhiker  0.000000000149768 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0962  cold shock protein  56.92 
 
 		 67 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000153995  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2326  cold shock protein CspG  61.29 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000227415  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1099  cold shock protein CspG  61.29 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0958  cold shock protein  56.92 
 
 		 67 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.000000000000117939  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2607  cold shock protein CspG  61.29 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286712  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4409  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.38 
 
 		 67 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2135  cold shock protein CspG  61.29 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0493  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  56.06 
 
 		 66 aa  82.8  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.156279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0574  cold-shock domain-contain protein  56.92 
 
 		 67 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000358394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>