26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_31380 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009358  OSTLU_31380  predicted protein  100 
 
 		 278 aa  556  1e-157  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0913  pseudouridine synthase  32.85 
 
 		 566 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000952399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06934  ribosomal large chain pseudouridine synthase A  31.75 
 
 		 523 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000939  pseudouridylate synthase LSU rRNA-specific  31.97 
 
 		 559 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0570  putative RNA pseudouridylate synthase  30.51 
 
 		 561 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2529  pseudouridine synthase  31.87 
 
 		 578 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3138  pseudouridine synthase  32.32 
 
 		 549 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2989  pseudouridine synthase  30.63 
 
 		 548 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3017  pseudouridine synthase  29.37 
 
 		 572 aa  122  8e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1091  pseudouridine synthase  29.71 
 
 		 574 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0886  pseudouridine synthase  31.64 
 
 		 579 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4402  pseudouridine synthase  28.21 
 
 		 570 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1058  pseudouridine synthase  28.99 
 
 		 574 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0988  pseudouridine synthase  29.35 
 
 		 574 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3182  pseudouridine synthase  28.97 
 
 		 551 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.186572  normal  0.110581 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2914  pseudouridine synthase  28.97 
 
 		 551 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0688  pseudouridine synthase  30.15 
 
 		 593 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.241992  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1000  pseudouridine synthase  29.35 
 
 		 574 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2328  pseudouridine synthase  29.24 
 
 		 567 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3301  pseudouridine synthase  27.9 
 
 		 574 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0536  RNA pseudouridine synthase family protein  28.75 
 
 		 567 aa  102  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1374  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.23 
 
 		 543 aa  101  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0734  ribosomal large subunit pseudouridylate synthase  33.33 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2665  hypothetical protein  39.05 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0569  putative RNA pseudouridylate synthase  23.31 
 
 		 561 aa  73.6  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5152  hypothetical protein  36.04 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158632  hitchhiker  0.00137129 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>