21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0513 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0513  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  764    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.543532  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0438  hypothetical protein  91.95 
 
 		 375 aa  662    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.610548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0245  hypothetical protein  81.25 
 
 		 383 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0590  hypothetical protein  82.34 
 
 		 382 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0152  hypothetical protein  79.14 
 
 		 393 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0428  hypothetical protein  76.4 
 
 		 379 aa  565  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0150  conserved hypothetical protein; putative glucokinase  76.77 
 
 		 387 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.957709  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1393  putative glucokinase  58.19 
 
 		 361 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556466  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0859  putative glucokinase  57.31 
 
 		 361 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0984408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6318  hypothetical protein  57.52 
 
 		 361 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3666  hypothetical protein  56.51 
 
 		 355 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707046 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4596  hypothetical protein  57.23 
 
 		 361 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1736  hypothetical protein  51.58 
 
 		 350 aa  362  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3036  hypothetical protein  48.75 
 
 		 381 aa  346  4e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0658384  normal  0.183249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0778  ATPase AAA-2 domain protein  46 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4671  hypothetical protein  45.45 
 
 		 101 aa  62.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.651437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  27.59 
 
 		 316 aa  49.3  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0868  ROK family protein  25.3 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.826865  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0928  ROK family protein  30.36 
 
 		 329 aa  45.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.400197 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  24.42 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2399  ROK family protein  30.3 
 
 		 270 aa  42.7  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>