23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1736 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1736  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  709    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0428  hypothetical protein  55.36 
 
 		 379 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3036  hypothetical protein  55.13 
 
 		 381 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0658384  normal  0.183249 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0590  hypothetical protein  53.82 
 
 		 382 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6318  hypothetical protein  52.48 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0152  hypothetical protein  51.58 
 
 		 393 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0150  conserved hypothetical protein; putative glucokinase  52.94 
 
 		 387 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.957709  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3666  hypothetical protein  51.76 
 
 		 355 aa  363  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707046 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0245  hypothetical protein  52.94 
 
 		 383 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0513  hypothetical protein  51.44 
 
 		 378 aa  360  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.543532  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0859  putative glucokinase  52.72 
 
 		 361 aa  359  3e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0984408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1393  putative glucokinase  52.35 
 
 		 361 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556466  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0438  hypothetical protein  52.24 
 
 		 375 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.610548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4596  hypothetical protein  51.91 
 
 		 361 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0778  ATPase AAA-2 domain protein  41.55 
 
 		 386 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4671  hypothetical protein  86.84 
 
 		 101 aa  73.9  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.651437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  27.33 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2462  ROK family protein  30.22 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2841  ROK family protein  30.22 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.20695  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  23.35 
 
 		 316 aa  43.1  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0758  ROK family protein  27.38 
 
 		 292 aa  43.1  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.022623  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  27.54 
 
 		 311 aa  42.7  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3960  ROK family protein  27.54 
 
 		 302 aa  42.7  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>