27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1393 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1393  putative glucokinase  100 
 
 		 361 aa  717    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556466  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0859  putative glucokinase  88.61 
 
 		 361 aa  645    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0984408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0513  hypothetical protein  58.41 
 
 		 378 aa  422  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.543532  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0428  hypothetical protein  57.34 
 
 		 379 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0150  conserved hypothetical protein; putative glucokinase  58.02 
 
 		 387 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.957709  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0438  hypothetical protein  59.29 
 
 		 375 aa  421  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.610548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0245  hypothetical protein  57.18 
 
 		 383 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0152  hypothetical protein  56.3 
 
 		 393 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0590  hypothetical protein  57.18 
 
 		 382 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3666  hypothetical protein  55.85 
 
 		 355 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707046 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6318  hypothetical protein  54.2 
 
 		 361 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4596  hypothetical protein  54.29 
 
 		 361 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1736  hypothetical protein  52.35 
 
 		 350 aa  357  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3036  hypothetical protein  50.43 
 
 		 381 aa  334  1e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0658384  normal  0.183249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0778  ATPase AAA-2 domain protein  44.37 
 
 		 386 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4671  hypothetical protein  66.67 
 
 		 101 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.651437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0758  ROK family protein  30.91 
 
 		 292 aa  49.3  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.022623  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  29.44 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  31.18 
 
 		 311 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  30.06 
 
 		 332 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0868  ROK family protein  27.38 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.826865  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13470  Polyphosphate glucokinase  30.05 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372457  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0418  ROK family protein  24.54 
 
 		 291 aa  43.5  0.005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.370137  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0928  ROK family protein  29.17 
 
 		 329 aa  43.1  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.400197 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1172  polyphosphate glucokinase  29.21 
 
 		 266 aa  42.7  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.198413  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0306  ROK family protein  25.6 
 
 		 286 aa  42.7  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0299  ROK family protein  25.6 
 
 		 286 aa  42.7  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>