25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0859 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0859  putative glucokinase  100 
 
 
361 aa  709    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0984408  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1393  putative glucokinase  88.61 
 
 
361 aa  645    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556466  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0428  hypothetical protein  57.93 
 
 
379 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0438  hypothetical protein  58.11 
 
 
375 aa  411  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.610548  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0150  conserved hypothetical protein; putative glucokinase  56.89 
 
 
387 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.957709  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0513  hypothetical protein  57.23 
 
 
378 aa  410  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.543532  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0590  hypothetical protein  57.48 
 
 
382 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0152  hypothetical protein  56.3 
 
 
393 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3666  hypothetical protein  55.81 
 
 
355 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707046 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0245  hypothetical protein  56.3 
 
 
383 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6318  hypothetical protein  53.14 
 
 
361 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247104  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4596  hypothetical protein  53.43 
 
 
361 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1736  hypothetical protein  52.72 
 
 
350 aa  359  3e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3036  hypothetical protein  50.72 
 
 
381 aa  335  5e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0658384  normal  0.183249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0778  ATPase AAA-2 domain protein  44.37 
 
 
386 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4671  hypothetical protein  75 
 
 
101 aa  62.8  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.651437  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  30.59 
 
 
311 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0758  ROK family protein  30.3 
 
 
292 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.022623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0306  ROK family protein  25.14 
 
 
286 aa  47  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0299  ROK family protein  25.14 
 
 
286 aa  47  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0868  ROK family protein  28.57 
 
 
400 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.826865  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  27.22 
 
 
316 aa  43.9  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1172  polyphosphate glucokinase  32.58 
 
 
266 aa  43.5  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.198413  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  28.82 
 
 
332 aa  43.9  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0928  ROK family protein  28.73 
 
 
329 aa  43.5  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.400197 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>