17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0428 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0428  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  764    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0152  hypothetical protein  80.86 
 
 		 393 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0150  conserved hypothetical protein; putative glucokinase  79.49 
 
 		 387 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.957709  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0590  hypothetical protein  78.92 
 
 		 382 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0245  hypothetical protein  77.27 
 
 		 383 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0513  hypothetical protein  77.01 
 
 		 378 aa  556  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.543532  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0438  hypothetical protein  75 
 
 		 375 aa  548  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.610548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1393  putative glucokinase  57.34 
 
 		 361 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556466  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6318  hypothetical protein  60.36 
 
 		 361 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0859  putative glucokinase  57.93 
 
 		 361 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0984408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3666  hypothetical protein  57.69 
 
 		 355 aa  418  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707046 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4596  hypothetical protein  59.01 
 
 		 361 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1736  hypothetical protein  55.36 
 
 		 350 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3036  hypothetical protein  50.73 
 
 		 381 aa  349  4e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0658384  normal  0.183249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0778  ATPase AAA-2 domain protein  44 
 
 		 386 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4671  hypothetical protein  70.83 
 
 		 101 aa  66.2  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.651437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  26.9 
 
 		 332 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>