More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0778 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0778  ATPase AAA-2 domain protein  100 
 
 		 386 aa  762    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4466  ATPase  80.39 
 
 		 964 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2291  ATPase  74.88 
 
 		 566 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3393  ATPase  75.37 
 
 		 949 aa  319  5e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246292  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3413  ATPase  74.88 
 
 		 949 aa  319  6e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0114965  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2370  ATPase  75.37 
 
 		 947 aa  319  6e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0304669 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1170  ATPase AAA-2  74.88 
 
 		 949 aa  318  7e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.501064  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3316  chaperone-associated ATPase, putative  75.86 
 
 		 940 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6193  ATPase AAA-2 domain protein  73.4 
 
 		 930 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0899  ATPase AAA-2 domain protein  71.08 
 
 		 894 aa  300  3e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000041024  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6998  putative ClpA/B protease, ATPase subunit  70.94 
 
 		 949 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5411  ATPase  69.95 
 
 		 953 aa  297  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0379558 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1406  ATPase AAA-2  70.94 
 
 		 946 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7086  ATPase  70.94 
 
 		 946 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355216  normal  0.126483 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6423  ATPase  70.94 
 
 		 946 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.707526  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3321  ATPase  70.19 
 
 		 935 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6417  ATPase  69.61 
 
 		 953 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283675  normal  0.243039 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5668  ATPase  69.61 
 
 		 953 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0564  putative ClpA/B protease ATP binding subunit  71.92 
 
 		 932 aa  295  8e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06000  putative ClpA/B protease ATP binding subunit  70.94 
 
 		 850 aa  291  9e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0160864 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5916  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  65.75 
 
 		 942 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189322  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5495  ATPase  70.05 
 
 		 902 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5492  ATPase AAA-2 domain protein  65.7 
 
 		 944 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.311641  normal  0.315903 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6891  ATPase  65.22 
 
 		 944 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1887  putative ATP-dependent Clp protease, ATP- binding subunit  61.93 
 
 		 961 aa  265  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135075  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4012  ATPase  66.84 
 
 		 953 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1456  ATP-dependent chaperone ClpB  60.1 
 
 		 864 aa  250  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.893525  normal  0.727784 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0009  ATP-dependent chaperone ClpB  56.67 
 
 		 888 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0007  ATP-dependent chaperone ClpB  56.67 
 
 		 888 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2969  ATP-dependent chaperone ClpB  56.82 
 
 		 872 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.472161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3349  protein disaggregation chaperone  55.87 
 
 		 857 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000133942  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3475  protein disaggregation chaperone  55.87 
 
 		 857 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000223362  normal  0.392358 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3212  protein disaggregation chaperone  55.87 
 
 		 857 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315831  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1337  ATPase AAA-2  56.67 
 
 		 858 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184939  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0817  ATP-dependent chaperone ClpB  55.86 
 
 		 859 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.220377  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004392  ClpB protein  56.16 
 
 		 857 aa  243  6e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000934943  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01442  ClpB protein  55.61 
 
 		 824 aa  243  6e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2027  ATP-dependent chaperone ClpB  57.14 
 
 		 860 aa  242  7e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000180597  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2309  ATP-dependent chaperone ClpB  57.28 
 
 		 872 aa  242  7e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2032  ATP-dependent chaperone ClpB  57.14 
 
 		 862 aa  242  9e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.705253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0886  protein disaggregation chaperone  56.07 
 
 		 857 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000176912  normal  0.0332416 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2015  ClpB  53.6 
 
 		 859 aa  241  2e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1007  ATPase  54.94 
 
 		 862 aa  241  2e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.783787 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0414  AAA ATPase  56.65 
 
 		 854 aa  241  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.817995  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1907  ATP-dependent chaperone ClpB  56.39 
 
 		 864 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.442635 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1604  ATPase  56.52 
 
 		 863 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.234321  normal  0.194925 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2413  ATPase AAA-2 domain protein  57.64 
 
 		 442 aa  240  4e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01007  hypothetical protein  55.67 
 
 		 857 aa  239  5.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4582  ATP-dependent chaperone ClpB  55.66 
 
 		 899 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.994728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3490  ATPase AAA-2  55.67 
 
 		 905 aa  239  5.999999999999999e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0179  ATP-dependent chaperone ClpB  55.17 
 
 		 859 aa  239  6.999999999999999e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4974  ATPase  58.21 
 
 		 859 aa  239  8e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4861  ATP-dependent chaperone ClpB  55.24 
 
 		 890 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.806097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5381  ATP-dependent chaperone ClpB  57.69 
 
 		 878 aa  239  9e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2335  ATPase  56.8 
 
 		 872 aa  238  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0630  ATPase  58.05 
 
 		 890 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.841599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2159  ATPase  60.59 
 
 		 941 aa  238  1e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.513244  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4001  ATP-dependent chaperone ClpB  56.44 
 
 		 871 aa  238  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00358215  normal  0.0224301 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1042  hypothetical protein  57.35 
 
 		 867 aa  238  1e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0887  ATP-dependent chaperone ClpB  57.08 
 
 		 854 aa  238  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.763856  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2046  ATP-dependent chaperone ClpB  56.86 
 
 		 871 aa  237  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0823  putative chaperonin clpA/B  56.16 
 
 		 865 aa  237  2e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00549001 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0589  AAA ATPase  55.29 
 
 		 891 aa  237  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.917819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0083  ATPase AAA-2 domain protein  55.12 
 
 		 811 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.181403  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0841  ATPase AAA-2  56.16 
 
 		 865 aa  238  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18321  ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  58.05 
 
 		 863 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.207261 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0079  ATPase AAA-2 domain protein  55.83 
 
 		 810 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0911  ATPase  55.67 
 
 		 862 aa  237  3e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3141  protein disaggregation chaperone  54.93 
 
 		 857 aa  237  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0416591  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5085  ATP-dependent chaperone ClpB  57.21 
 
 		 878 aa  236  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2054  ATPase  56.16 
 
 		 441 aa  236  4e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1089  ATPase  53.64 
 
 		 883 aa  236  4e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000277828 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2696  ATPase  56.8 
 
 		 862 aa  236  4e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0499  ATPase AAA-2  58.13 
 
 		 860 aa  236  4e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333931  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5444  ATP-dependent chaperone ClpB  56.73 
 
 		 874 aa  236  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0076  ATPase  56.1 
 
 		 811 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0199  ATP-dependent Clp protease, subunit B  54.17 
 
 		 856 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2558  ATPase  57.14 
 
 		 864 aa  236  5.0000000000000005e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111038  hitchhiker  0.00562869 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2198  ATPase AAA-2  55.67 
 
 		 861 aa  236  6e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.105301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0240  clpB protein  55.88 
 
 		 857 aa  236  6e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000492438  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2208  ATP-dependent chaperone ClpB  54.85 
 
 		 863 aa  236  7e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.250502 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0835  ATPase  54.72 
 
 		 816 aa  235  8e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3123  heat shock protein  54.19 
 
 		 871 aa  235  8e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0140  ATPase  54.72 
 
 		 876 aa  235  9e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.182889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3813  ATP-dependent chaperone ClpB  59.8 
 
 		 866 aa  235  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0054  ATPase  55.34 
 
 		 792 aa  235  9e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000145392  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2465  ATP-dependent chaperone ClpB  56.19 
 
 		 880 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0836  ATP-dependent chaperone ClpB  58.71 
 
 		 860 aa  234  1.0000000000000001e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00212148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3521  ATP-dependent chaperone ClpB  58.79 
 
 		 866 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0824402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2007  ATP-dependent chaperone ClpB  54.9 
 
 		 863 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.324235  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3609  ATPase  56.16 
 
 		 860 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0766935  normal  0.0261141 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0054  ATPase  54.37 
 
 		 792 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000677637  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0876  ATPase  54.68 
 
 		 862 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000166403 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3106  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  58.62 
 
 		 859 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652443  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0823  ATP-dependent chaperone ClpB  56.25 
 
 		 865 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457177  normal  0.714446 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0076  ATPase  55.61 
 
 		 811 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4247  AAA_5 ATPase  54.81 
 
 		 879 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0997657  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1813  ATP-dependent chaperone ClpB  52.7 
 
 		 865 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.264392 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2996  ATPase AAA-2  56.67 
 
 		 891 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3729  ATP-dependent chaperone ClpB  56.25 
 
 		 874 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>