17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0150 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0150  conserved hypothetical protein; putative glucokinase  100 
 
 		 387 aa  784    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.957709  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0245  hypothetical protein  85.23 
 
 		 383 aa  626  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0152  hypothetical protein  81.55 
 
 		 393 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0590  hypothetical protein  84.38 
 
 		 382 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0428  hypothetical protein  79.49 
 
 		 379 aa  589  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0513  hypothetical protein  76.86 
 
 		 378 aa  565  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.543532  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0438  hypothetical protein  75.14 
 
 		 375 aa  558  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.610548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1393  putative glucokinase  58.02 
 
 		 361 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556466  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6318  hypothetical protein  58.7 
 
 		 361 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0859  putative glucokinase  56.89 
 
 		 361 aa  421  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0984408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4596  hypothetical protein  58.11 
 
 		 361 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3666  hypothetical protein  55.62 
 
 		 355 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707046 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1736  hypothetical protein  53.24 
 
 		 350 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3036  hypothetical protein  49 
 
 		 381 aa  350  3e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0658384  normal  0.183249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0778  ATPase AAA-2 domain protein  46 
 
 		 386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4671  hypothetical protein  73.17 
 
 		 101 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.651437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  27.54 
 
 		 316 aa  47.4  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>