19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3036 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3036  hypothetical protein  100 
 
 
381 aa  774    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0658384  normal  0.183249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1736  hypothetical protein  55.07 
 
 
350 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0428  hypothetical protein  50.73 
 
 
379 aa  348  7e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0245  hypothetical protein  51.02 
 
 
383 aa  342  8e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0438  hypothetical protein  50.14 
 
 
375 aa  342  1e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.610548  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0513  hypothetical protein  49.57 
 
 
378 aa  340  2e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.543532  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0152  hypothetical protein  48.43 
 
 
393 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0150  conserved hypothetical protein; putative glucokinase  49.27 
 
 
387 aa  338  8e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.957709  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0590  hypothetical protein  50.15 
 
 
382 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0859  putative glucokinase  50.72 
 
 
361 aa  336  5e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0984408  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1393  putative glucokinase  50.43 
 
 
361 aa  335  9e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556466  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3666  hypothetical protein  48.26 
 
 
355 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707046 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6318  hypothetical protein  46.39 
 
 
361 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247104  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4596  hypothetical protein  46.67 
 
 
361 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0778  ATPase AAA-2 domain protein  38.06 
 
 
386 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4671  hypothetical protein  73.68 
 
 
101 aa  64.3  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.651437  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3960  ROK family protein  29.52 
 
 
302 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  25.6 
 
 
332 aa  44.3  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  25.58 
 
 
316 aa  43.1  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>