21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0245 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0245  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  775    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0590  hypothetical protein  92.33 
 
 		 382 aa  659    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0150  conserved hypothetical protein; putative glucokinase  84.55 
 
 		 387 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.957709  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0152  hypothetical protein  81.13 
 
 		 393 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0513  hypothetical protein  81.14 
 
 		 378 aa  586  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.543532  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0438  hypothetical protein  78.57 
 
 		 375 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.610548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0428  hypothetical protein  76.6 
 
 		 379 aa  566  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6318  hypothetical protein  58.82 
 
 		 361 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1393  putative glucokinase  57.02 
 
 		 361 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556466  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4596  hypothetical protein  58.36 
 
 		 361 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3666  hypothetical protein  57.1 
 
 		 355 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707046 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0859  putative glucokinase  56.14 
 
 		 361 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0984408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1736  hypothetical protein  53.12 
 
 		 350 aa  364  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3036  hypothetical protein  49.86 
 
 		 381 aa  345  7e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0658384  normal  0.183249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0778  ATPase AAA-2 domain protein  44.67 
 
 		 386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4671  hypothetical protein  68.09 
 
 		 101 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.651437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  28.57 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  28.24 
 
 		 316 aa  47  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2462  ROK family protein  31.25 
 
 		 315 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2841  ROK family protein  31.25 
 
 		 315 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.20695  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0928  ROK family protein  30.32 
 
 		 329 aa  42.7  0.01  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.400197 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>