80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3345 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3345  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
207 aa  414  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00984287  normal  0.068906 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1722  GDSL family lipase  42.64 
 
 
202 aa  151  8e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.862782  normal  0.0152444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3904  lipolytic protein  39.29 
 
 
216 aa  146  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3233  hypothetical protein  45.65 
 
 
184 aa  137  7.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.826377  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2845  lipolytic protein G-D-S-L family  43.2 
 
 
199 aa  137  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.277624  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1227  lipolytic protein G-D-S-L family  41.54 
 
 
200 aa  125  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1269  GDSL family lipase  40.82 
 
 
205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68663  normal  0.165009 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1216  acyl-CoA thioesterase I precursor  38.78 
 
 
199 aa  104  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2490  acyl-CoA thioesterase I precursor  36.04 
 
 
201 aa  101  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.860035  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1807  hypothetical protein  35 
 
 
200 aa  94.4  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18470  hypothetical protein  34.69 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0868279  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09530  hypothetical protein  35.35 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2380  hypothetical protein  33.67 
 
 
199 aa  89  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000388199 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2646  hypothetical protein  33.67 
 
 
199 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.168668  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07720  hypothetical protein  33.51 
 
 
201 aa  86.3  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.158265  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19430  lysophospholipase L1-like esterase  31.94 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1774  lipolytic protein G-D-S-L family  31.58 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4796  lipolytic protein  31.31 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3589  G-D-S-L family lipolytic protein  31.03 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474634  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4506  lipolytic protein G-D-S-L family  31.5 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4444  lipolytic protein G-D-S-L family  31.5 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0762  lipolytic protein G-D-S-L family  30.58 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2546  hypothetical protein  28.24 
 
 
239 aa  62  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.109536  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1291  hypothetical protein  29.1 
 
 
228 aa  60.8  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3442  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.62 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0102  arylesterase  24.64 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07271  lysophospholipase L1 and related esterases  24.64 
 
 
215 aa  55.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0199711  normal  0.0101473 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07831  lysophospholipase L1 and related esterase  25.98 
 
 
220 aa  55.5  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00632234 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  33.33 
 
 
216 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  28.93 
 
 
233 aa  55.1  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14281  lysophospholipase L1  27.01 
 
 
225 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3955  hypothetical protein  28.21 
 
 
211 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0133158 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  28.65 
 
 
219 aa  52.8  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07431  lysophospholipase L1 and related esterase  23.3 
 
 
214 aa  52.4  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.833835  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07231  lysophospholipase L1 and related esterase  24.15 
 
 
214 aa  52.4  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.613017  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4178  esterase  26.5 
 
 
255 aa  51.6  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0335834  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  26.53 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07251  lysophospholipase L1  23.79 
 
 
214 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.537242  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0670  hypothetical protein  23.79 
 
 
214 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212223  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  25.38 
 
 
214 aa  48.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1599  lipolytic protein G-D-S-L family  27.08 
 
 
222 aa  47.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2141  GDSL family lipase  28.06 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.336589  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3286  GDSL family lipase  27.6 
 
 
208 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3601  GDSL family lipase  27.6 
 
 
208 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  27.23 
 
 
202 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  24.47 
 
 
183 aa  47  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  29.56 
 
 
202 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1944  acyl-CoA thioesterase, putative  30.37 
 
 
210 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1451  acyl-CoA thioesterase I  30.37 
 
 
210 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0796987  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1219  acyl-CoA thioesterase, putative  30.37 
 
 
226 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  27.55 
 
 
251 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1186  hypothetical protein  28.64 
 
 
223 aa  45.8  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.289249  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  26.63 
 
 
201 aa  45.8  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3360  acyl-CoA thioesterase I  30.37 
 
 
226 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.323811  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  27.36 
 
 
205 aa  45.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1250  arylesterase  27.96 
 
 
208 aa  45.1  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2468  acyl-CoA thioesterase I  30.37 
 
 
232 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2349  acyl-CoA thioesterase I  30.37 
 
 
226 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342974  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2311  acyl-CoA thioesterase I  30.37 
 
 
226 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3416  esterase  24.34 
 
 
188 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0484902  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2630  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.4 
 
 
198 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0895129  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  24.39 
 
 
239 aa  43.9  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  24.76 
 
 
241 aa  44.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2933  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.32 
 
 
218 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.594206  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  27.03 
 
 
214 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  24.27 
 
 
241 aa  43.1  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25 
 
 
204 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.38 
 
 
226 aa  42.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  26.63 
 
 
255 aa  42.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  25.13 
 
 
205 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  26.8 
 
 
202 aa  42.4  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.4 
 
 
211 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0938  arylesterase  25.13 
 
 
219 aa  42.4  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.279693  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5710  lipolytic protein G-D-S-L family  25.65 
 
 
249 aa  42  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80532  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  26.15 
 
 
201 aa  41.6  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1278  GDSL family lipase  25.77 
 
 
223 aa  42  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398687  normal  0.0389661 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4035  arylesterase  27.78 
 
 
214 aa  41.6  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0926755 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2130  acyl-CoA thioesterase I  29.32 
 
 
232 aa  41.6  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0925332  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  26.8 
 
 
201 aa  41.2  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3922  GDSL family lipase  33.33 
 
 
270 aa  41.2  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0503745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>