51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1227 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1227  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
200 aa  399  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09530  hypothetical protein  58.08 
 
 
206 aa  226  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1269  GDSL family lipase  56.99 
 
 
205 aa  219  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68663  normal  0.165009 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2490  acyl-CoA thioesterase I precursor  56.99 
 
 
201 aa  218  6e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.860035  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1807  hypothetical protein  55.1 
 
 
200 aa  216  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1216  acyl-CoA thioesterase I precursor  56.63 
 
 
199 aa  214  7e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07720  hypothetical protein  56.92 
 
 
201 aa  214  8e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.158265  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2646  hypothetical protein  53.85 
 
 
199 aa  210  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.168668  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2380  hypothetical protein  53.33 
 
 
199 aa  205  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000388199 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18470  hypothetical protein  50.78 
 
 
224 aa  194  8.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0868279  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19430  lysophospholipase L1-like esterase  48.22 
 
 
214 aa  185  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3345  lipolytic protein G-D-S-L family  41.71 
 
 
207 aa  125  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00984287  normal  0.068906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2845  lipolytic protein G-D-S-L family  39.09 
 
 
199 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.277624  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1722  GDSL family lipase  34.34 
 
 
202 aa  121  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.862782  normal  0.0152444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3904  lipolytic protein  34.17 
 
 
216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3233  hypothetical protein  36.17 
 
 
184 aa  97.1  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.826377  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0762  lipolytic protein G-D-S-L family  29.95 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4444  lipolytic protein G-D-S-L family  29.38 
 
 
230 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4506  lipolytic protein G-D-S-L family  29.38 
 
 
230 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2546  hypothetical protein  28.19 
 
 
239 aa  55.5  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.109536  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4796  lipolytic protein  27.54 
 
 
239 aa  55.5  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  30.11 
 
 
233 aa  54.7  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1774  lipolytic protein G-D-S-L family  25.24 
 
 
229 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3589  G-D-S-L family lipolytic protein  26.96 
 
 
237 aa  52.8  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474634  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3442  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.86 
 
 
232 aa  51.2  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3685  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.42 
 
 
228 aa  51.2  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0938  arylesterase  23.16 
 
 
219 aa  47  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.279693  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07231  lysophospholipase L1 and related esterase  22.34 
 
 
214 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.613017  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3286  GDSL family lipase  32.74 
 
 
208 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07251  lysophospholipase L1  22.34 
 
 
214 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.537242  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0670  hypothetical protein  21.83 
 
 
214 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212223  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3601  GDSL family lipase  32.74 
 
 
208 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  25.88 
 
 
216 aa  45.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4401  lipolytic protein G-D-S-L family  25.24 
 
 
728 aa  45.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2271  GDSL family lipase  29.82 
 
 
215 aa  45.1  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.806059  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1603  lipolytic protein G-D-S-L family  29.82 
 
 
215 aa  45.1  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1829  esterase  22.22 
 
 
188 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0305538  normal  0.13667 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  23.03 
 
 
205 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3955  hypothetical protein  28.34 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0133158 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  24.12 
 
 
202 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3416  esterase  23.45 
 
 
188 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0484902  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  24.12 
 
 
205 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0686  acyl-CoA thioesterase I precursor  26.79 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  24.66 
 
 
261 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07831  lysophospholipase L1 and related esterase  21.94 
 
 
220 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00632234 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07431  lysophospholipase L1 and related esterase  22.34 
 
 
214 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.833835  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  26.14 
 
 
255 aa  42.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  25.27 
 
 
201 aa  42.4  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1901  GDSL family lipase  28.12 
 
 
214 aa  42.4  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0627412 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  21.26 
 
 
209 aa  41.6  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  22.16 
 
 
183 aa  41.2  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>