23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1186 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1186  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  456  1e-127  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.289249  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1291  hypothetical protein  70.32 
 
 
228 aa  328  3e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14281  lysophospholipase L1  62.27 
 
 
225 aa  293  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07831  lysophospholipase L1 and related esterase  56.87 
 
 
220 aa  272  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00632234 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0102  arylesterase  56.19 
 
 
215 aa  271  7e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07271  lysophospholipase L1 and related esterases  56.19 
 
 
215 aa  270  1e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0199711  normal  0.0101473 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0670  hypothetical protein  54.81 
 
 
214 aa  245  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212223  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07231  lysophospholipase L1 and related esterase  54.33 
 
 
214 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.613017  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07251  lysophospholipase L1  53.59 
 
 
214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.537242  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07431  lysophospholipase L1 and related esterase  53.37 
 
 
214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.833835  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2546  hypothetical protein  43.48 
 
 
239 aa  177  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.109536  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4444  lipolytic protein G-D-S-L family  38.16 
 
 
230 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4506  lipolytic protein G-D-S-L family  38.16 
 
 
230 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0762  lipolytic protein G-D-S-L family  39.41 
 
 
222 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3442  lipolytic enzyme, G-D-S-L  37.44 
 
 
232 aa  142  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1774  lipolytic protein G-D-S-L family  33.97 
 
 
229 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3589  G-D-S-L family lipolytic protein  36.97 
 
 
237 aa  134  8e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474634  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4796  lipolytic protein  36.97 
 
 
239 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3345  lipolytic protein G-D-S-L family  28.22 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00984287  normal  0.068906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2845  lipolytic protein G-D-S-L family  31.63 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.277624  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1722  GDSL family lipase  25.73 
 
 
202 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.862782  normal  0.0152444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3904  lipolytic protein  24.27 
 
 
216 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0686  acyl-CoA thioesterase I precursor  27.36 
 
 
206 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.354369 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>