33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_18470 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_18470  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  455  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0868279  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1227  lipolytic protein G-D-S-L family  50.78 
 
 
200 aa  194  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2646  hypothetical protein  47.64 
 
 
199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.168668  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1269  GDSL family lipase  50 
 
 
205 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68663  normal  0.165009 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2380  hypothetical protein  47.12 
 
 
199 aa  169  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000388199 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2490  acyl-CoA thioesterase I precursor  46.91 
 
 
201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.860035  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07720  hypothetical protein  47.45 
 
 
201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.158265  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09530  hypothetical protein  46.73 
 
 
206 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1807  hypothetical protein  44.06 
 
 
200 aa  153  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1216  acyl-CoA thioesterase I precursor  43.59 
 
 
199 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19430  lysophospholipase L1-like esterase  38.89 
 
 
214 aa  144  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2845  lipolytic protein G-D-S-L family  38.46 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.277624  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3345  lipolytic protein G-D-S-L family  34.69 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00984287  normal  0.068906 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1722  GDSL family lipase  30.41 
 
 
202 aa  94.7  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.862782  normal  0.0152444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3904  lipolytic protein  28.64 
 
 
216 aa  85.9  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3233  hypothetical protein  32.26 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.826377  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1774  lipolytic protein G-D-S-L family  26.38 
 
 
229 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3589  G-D-S-L family lipolytic protein  26.87 
 
 
237 aa  52.8  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474634  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0762  lipolytic protein G-D-S-L family  28.08 
 
 
222 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4444  lipolytic protein G-D-S-L family  28.8 
 
 
230 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4796  lipolytic protein  28.04 
 
 
239 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4506  lipolytic protein G-D-S-L family  28.8 
 
 
230 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2310  GDSL family lipase  27.81 
 
 
307 aa  48.9  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3442  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.82 
 
 
232 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07251  lysophospholipase L1  25.73 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.537242  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0670  hypothetical protein  25.73 
 
 
214 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212223  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07231  lysophospholipase L1 and related esterase  26.7 
 
 
214 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.613017  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0686  acyl-CoA thioesterase I precursor  25.88 
 
 
206 aa  45.4  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07431  lysophospholipase L1 and related esterase  24.35 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.833835  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  24.86 
 
 
201 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14281  lysophospholipase L1  25.14 
 
 
225 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2546  hypothetical protein  26.04 
 
 
239 aa  43.5  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.109536  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07831  lysophospholipase L1 and related esterase  26.02 
 
 
220 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00632234 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>