29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3233 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3233  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  367  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.826377  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1722  GDSL family lipase  40.76 
 
 
202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.862782  normal  0.0152444 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3345  lipolytic protein G-D-S-L family  45.65 
 
 
207 aa  137  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00984287  normal  0.068906 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3904  lipolytic protein  39.78 
 
 
216 aa  136  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2845  lipolytic protein G-D-S-L family  41.76 
 
 
199 aa  125  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.277624  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1227  lipolytic protein G-D-S-L family  36.17 
 
 
200 aa  97.1  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1807  hypothetical protein  31.52 
 
 
200 aa  95.1  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1269  GDSL family lipase  36.17 
 
 
205 aa  91.7  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68663  normal  0.165009 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2490  acyl-CoA thioesterase I precursor  33.15 
 
 
201 aa  85.9  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.860035  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09530  hypothetical protein  35.94 
 
 
206 aa  84.7  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2380  hypothetical protein  32.79 
 
 
199 aa  84.7  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000388199 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1216  acyl-CoA thioesterase I precursor  34.07 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2646  hypothetical protein  32.79 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.168668  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07720  hypothetical protein  32.94 
 
 
201 aa  82  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.158265  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1774  lipolytic protein G-D-S-L family  29.27 
 
 
229 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18470  hypothetical protein  32.26 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0868279  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19430  lysophospholipase L1-like esterase  28.87 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4444  lipolytic protein G-D-S-L family  31.12 
 
 
230 aa  74.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4506  lipolytic protein G-D-S-L family  31.12 
 
 
230 aa  74.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0762  lipolytic protein G-D-S-L family  28.22 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3589  G-D-S-L family lipolytic protein  29.29 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474634  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4796  lipolytic protein  28.79 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3442  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.78 
 
 
232 aa  62  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2546  hypothetical protein  27.92 
 
 
239 aa  61.2  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.109536  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  29.06 
 
 
284 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  28.83 
 
 
293 aa  42.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4912  hypothetical protein  28 
 
 
283 aa  42.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106669  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  28.83 
 
 
293 aa  42.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14281  lysophospholipase L1  26.18 
 
 
225 aa  41.2  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>