30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_09530 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_09530  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  410  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1807  hypothetical protein  68.53 
 
 
200 aa  280  1e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1216  acyl-CoA thioesterase I precursor  68.69 
 
 
199 aa  270  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2490  acyl-CoA thioesterase I precursor  65.66 
 
 
201 aa  254  6e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.860035  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1269  GDSL family lipase  63.73 
 
 
205 aa  238  4e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68663  normal  0.165009 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1227  lipolytic protein G-D-S-L family  58.08 
 
 
200 aa  226  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2380  hypothetical protein  57.22 
 
 
199 aa  207  9e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000388199 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2646  hypothetical protein  57.73 
 
 
199 aa  206  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.168668  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07720  hypothetical protein  57.36 
 
 
201 aa  205  4e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.158265  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19430  lysophospholipase L1-like esterase  51.26 
 
 
214 aa  191  5e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18470  hypothetical protein  46.73 
 
 
224 aa  157  9e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0868279  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2845  lipolytic protein G-D-S-L family  38.27 
 
 
199 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.277624  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1722  GDSL family lipase  32.02 
 
 
202 aa  93.2  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.862782  normal  0.0152444 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3345  lipolytic protein G-D-S-L family  35.35 
 
 
207 aa  89.7  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00984287  normal  0.068906 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3904  lipolytic protein  30.29 
 
 
216 aa  89  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3233  hypothetical protein  35.94 
 
 
184 aa  84.7  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.826377  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4796  lipolytic protein  25.58 
 
 
239 aa  52  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1901  GDSL family lipase  33.12 
 
 
214 aa  47.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0627412 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0762  lipolytic protein G-D-S-L family  21.63 
 
 
222 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3589  G-D-S-L family lipolytic protein  24.1 
 
 
237 aa  45.8  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474634  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3286  GDSL family lipase  30.08 
 
 
208 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3442  lipolytic enzyme, G-D-S-L  24.23 
 
 
232 aa  45.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3601  GDSL family lipase  30.08 
 
 
208 aa  45.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  28.86 
 
 
216 aa  45.4  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1774  lipolytic protein G-D-S-L family  22.39 
 
 
229 aa  44.7  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4506  lipolytic protein G-D-S-L family  22.82 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4444  lipolytic protein G-D-S-L family  22.82 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3955  hypothetical protein  31.71 
 
 
211 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0133158 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1603  lipolytic protein G-D-S-L family  32.03 
 
 
215 aa  43.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2271  GDSL family lipase  32.03 
 
 
215 aa  43.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.806059  normal  0.446741 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>