101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3210 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3210  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  100 
 
 		 886 aa  1795    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0102635  hitchhiker  0.00134579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0888  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  48.72 
 
 		 791 aa  689    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.876313  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0021  hypothetical protein  47.41 
 
 		 573 aa  451  1e-125  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.587255  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0022  diguanylate phosphodiesterase  44.25 
 
 		 462 aa  180  9e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1568  cellulose synthase catalytic subunit  24.8 
 
 		 665 aa  73.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  24.91 
 
 		 788 aa  73.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373289 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 		 1140 aa  71.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  24.16 
 
 		 501 aa  71.2  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  25.15 
 
 		 712 aa  71.2  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 		 1140 aa  70.5  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 		 1140 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0340  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25.15 
 
 		 503 aa  68.2  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00114469  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0569  cellulose synthase (UDP-forming)  26.63 
 
 		 758 aa  67.8  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0333  cellulose synthase  24.18 
 
 		 788 aa  67.4  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.963251  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1978  cellulose synthase (UDP-forming)  24.18 
 
 		 788 aa  67.4  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1518  glycosyl transferase family 2  25.88 
 
 		 547 aa  64.7  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  25.88 
 
 		 778 aa  64.3  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  25.19 
 
 		 1129 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0230  Cellulose synthase (UDP-forming)  27.31 
 
 		 586 aa  63.5  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.634513  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00787  cellulose synthase catalytic subunit  22.14 
 
 		 707 aa  62.8  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  25.12 
 
 		 716 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  23.75 
 
 		 899 aa  59.7  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 		 889 aa  60.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0208  cellulose synthase (UDP-forming)  28.03 
 
 		 564 aa  60.1  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0946427  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05090  Cellulose synthase subunit AB  26.19 
 
 		 1455 aa  59.3  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 		 905 aa  58.9  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  24.66 
 
 		 930 aa  58.9  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  22.3 
 
 		 944 aa  58.9  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5208  cellulose synthase (UDP-forming)  25 
 
 		 726 aa  58.2  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  23.41 
 
 		 895 aa  57.4  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  22.38 
 
 		 831 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1204  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.11 
 
 		 730 aa  57  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1567  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  22.38 
 
 		 834 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.554043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  26.39 
 
 		 889 aa  56.6  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  23.75 
 
 		 919 aa  55.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1834  glycosyl transferase family 2  23.55 
 
 		 591 aa  56.2  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172396  normal  0.276871 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1312  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  22.86 
 
 		 822 aa  55.8  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779544  normal  0.794607 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1293  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.11 
 
 		 730 aa  55.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  23.26 
 
 		 811 aa  55.1  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1129  glucosyltransferase MdoH  26.98 
 
 		 721 aa  55.1  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.546183 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3940  cellulose synthase (UDP-forming)  28.24 
 
 		 699 aa  54.7  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0284472 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  24.78 
 
 		 425 aa  53.9  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  24.78 
 
 		 425 aa  53.9  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2136  cellulose synthase catalytic subunit  24.41 
 
 		 869 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3534  glucosyltransferase MdoH  22.74 
 
 		 641 aa  53.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2635  cellulose synthase catalytic subunit  25 
 
 		 869 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0275  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  21.46 
 
 		 794 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  22.82 
 
 		 804 aa  52.4  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3197  cellulose synthase catalytic subunit  24.5 
 
 		 869 aa  52  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.611786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  22.28 
 
 		 741 aa  52  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  22.29 
 
 		 810 aa  52  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4083  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  31.62 
 
 		 696 aa  52  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4186  glycosyl transferase family 2  24.7 
 
 		 537 aa  52  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  23.68 
 
 		 424 aa  52  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3042  Cellulose synthase (UDP-forming)  21.9 
 
 		 980 aa  52  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0324719 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0753  glycosyl transferase family 2  22.36 
 
 		 650 aa  51.2  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0746486  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1738  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 		 658 aa  50.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0016739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5535  cellulose synthase  25.9 
 
 		 729 aa  50.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3895  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  33.08 
 
 		 702 aa  50.8  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  22.95 
 
 		 737 aa  49.7  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3257  cellulose synthase (UDP-forming)  24.13 
 
 		 624 aa  50.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.660262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3154  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 		 620 aa  49.3  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  25.93 
 
 		 895 aa  48.9  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3450  Cellulose synthase (UDP-forming)  24.75 
 
 		 659 aa  48.9  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  22.04 
 
 		 501 aa  48.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4660  glycosyl transferase family 2  24.92 
 
 		 488 aa  48.5  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116626  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1514  glycosyltransferase  29.2 
 
 		 520 aa  48.1  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  23.5 
 
 		 672 aa  48.1  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  21 
 
 		 889 aa  47.4  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1116  cellulose synthase (UDP-forming)  27.17 
 
 		 691 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.772245 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  23.5 
 
 		 672 aa  47.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1164  cellulose synthase (UDP-forming)  28.74 
 
 		 652 aa  47.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1324  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.74 
 
 		 652 aa  47.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.531441  normal  0.84698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6543  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  25.14 
 
 		 514 aa  47.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000751744 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  22.07 
 
 		 442 aa  46.6  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1338  glycosyl transferase family protein  22.92 
 
 		 772 aa  46.6  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04141  glucosyltransferase MdoH  28.31 
 
 		 611 aa  46.6  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617377  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0273  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.14 
 
 		 652 aa  47  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.79882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0794  cellulose synthase (UDP-forming)  26.67 
 
 		 683 aa  45.8  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.298349  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4219  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 		 659 aa  45.8  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  22.95 
 
 		 672 aa  46.2  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  22.22 
 
 		 1231 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  21.86 
 
 		 666 aa  45.8  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3905  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  25.28 
 
 		 570 aa  45.8  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.504805  normal  0.221865 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0232  Cellulose synthase (UDP-forming)  24.78 
 
 		 544 aa  45.8  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  25.97 
 
 		 412 aa  45.4  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0076  cellulose synthase catalytic subunit  25.18 
 
 		 899 aa  45.4  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  25.97 
 
 		 441 aa  45.1  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  25.97 
 
 		 441 aa  45.1  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  23.59 
 
 		 749 aa  45.1  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1704  glycosyl transferase family protein  24.09 
 
 		 514 aa  45.1  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  25.97 
 
 		 441 aa  45.1  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  25.97 
 
 		 441 aa  45.1  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  25.97 
 
 		 441 aa  45.1  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5236  cellulose synthase (UDP-forming)  26.32 
 
 		 659 aa  44.7  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0282  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25.81 
 
 		 341 aa  44.7  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3939  cellulose synthase catalytic subunit  25.29 
 
 		 872 aa  44.7  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.556774  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2615  Cellulose synthase (UDP-forming)  24.64 
 
 		 641 aa  44.7  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  26.95 
 
 		 868 aa  44.7  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  25.97 
 
 		 412 aa  44.3  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498109 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>