More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2746 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2746  single-strand binding protein  100 
 
 		 184 aa  367  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000389389  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4429  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  39.83 
 
 		 177 aa  84.3  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.364472 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  39.32 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  36.02 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  39.64 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  38.94 
 
 		 165 aa  67.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  39.64 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  37.93 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  36.28 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  39.64 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  39.64 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  34.36 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  39.64 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  33.13 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  39.64 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  35.9 
 
 		 192 aa  62  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  37.17 
 
 		 219 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  31.71 
 
 		 166 aa  62  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  33.63 
 
 		 193 aa  62  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  37.72 
 
 		 188 aa  62  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  30.33 
 
 		 148 aa  62  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  37.17 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  34.51 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  37.17 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  32.48 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  33.63 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  33.63 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  35.59 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  34.82 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  37.17 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  34.48 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  38.39 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  35.4 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  34.41 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  30.43 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  35.96 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  34.31 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  31.65 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  34.86 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  31.65 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  33.08 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  31.65 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  31.65 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  34.41 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  34.95 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  35.04 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  30.7 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  31.62 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  31.62 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  28.7 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4211  single-strand binding protein  40.45 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000000040739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  30.6 
 
 		 305 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  35.29 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  35.4 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  37.04 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2228  single-stranded DNA-binding protein  34.31 
 
 		 111 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0484  single-strand binding protein  36.47 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759205  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  32.74 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1615  single-stranded DNA-binding protein  37.18 
 
 		 121 aa  52.8  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000019997  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  33.04 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  34.78 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0025  single-strand DNA-binding protein  42.31 
 
 		 146 aa  52  0.000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0165  single-strand binding protein  38 
 
 		 301 aa  52  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000779972  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2003  single-stranded DNA-binding protein  35.9 
 
 		 112 aa  52.4  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000170314  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  37.66 
 
 		 146 aa  52.4  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2193  single-stranded DNA-binding protein  34.31 
 
 		 112 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  30.53 
 
 		 158 aa  51.6  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1985  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 112 aa  51.6  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.73019e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3142  single-stranded DNA-binding protein  35.9 
 
 		 111 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467744  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  27.78 
 
 		 164 aa  51.2  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2176  single-stranded DNA-binding protein  35.9 
 
 		 111 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2013  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 112 aa  51.2  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00346056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1967  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 112 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000581138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2168  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 112 aa  51.2  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000365477  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  31.25 
 
 		 156 aa  50.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0828  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 275 aa  50.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.333907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2263  single-strand binding protein  34.48 
 
 		 119 aa  50.4  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000257141  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  34.74 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 150 aa  50.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  34.38 
 
 		 188 aa  50.4  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  30.1 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  30.1 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  31.52 
 
 		 125 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  30.1 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  30.1 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  30.1 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  32.35 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  37.35 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  30.1 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  34.69 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  28.68 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  30.53 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  30.1 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2311  single-stranded DNA-binding protein  35.9 
 
 		 111 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000965413  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  30.43 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  30.1 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  32.35 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  28.7 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  31.52 
 
 		 125 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>