30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0420 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0420  DNA primase small subunit  100 
 
 
395 aa  798    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.669616  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1392  DNA primase small subunit  47.87 
 
 
390 aa  354  2e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1571  DNA primase small subunit  43.03 
 
 
414 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2047  putative DNA primase, small subunit  44.8 
 
 
387 aa  294  2e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1955  putative DNA primase, small subunit  39.8 
 
 
374 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.804448 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0953  DNA primase, small subunit  39.61 
 
 
378 aa  273  3e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2753  DNA primase small subunit  41.25 
 
 
386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2482  DNA primase, small subunit  41.09 
 
 
392 aa  268  1e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0410  DNA primase, small subunit  41.9 
 
 
391 aa  265  8e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2564  DNA primase, small subunit  41.25 
 
 
391 aa  263  3e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1245  DNA primase, small subunit  38.61 
 
 
404 aa  263  6e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1132  DNA primase, small subunit, putative  38.14 
 
 
388 aa  261  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1798  DNA primase small subunit  40.7 
 
 
387 aa  256  7e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1303  DNA primase small subunit  39.21 
 
 
380 aa  255  8e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0622  putative DNA primase, small subunit  35.17 
 
 
389 aa  193  4e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1787  putative DNA primase, small subunit  42.78 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.057405 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0066  DNA primase small subunit  26.71 
 
 
373 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2019  DNA primase small subunit  31.25 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1683  DNA primase, small subunit  42.22 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.773478 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0437  putative DNA primase, small subunit  40.57 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0991  DNA primase small subunit  39.44 
 
 
312 aa  120  3e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1378  putative DNA primase, small subunit  38.64 
 
 
348 aa  119  7e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.214397  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1793  DNA primase small subunit  33.91 
 
 
320 aa  96.3  8e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0877  DNA primase, small subunit  25.93 
 
 
357 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1606  DNA primase small subunit  25.93 
 
 
357 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1070  putative DNA primase, small subunit  26.52 
 
 
363 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1084  putative DNA primase, small subunit  28.65 
 
 
355 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.346262  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0882  putative DNA primase, small subunit  23.4 
 
 
364 aa  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506684  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01650  conserved hypothetical protein  22.44 
 
 
429 aa  47  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54992  predicted protein  25.73 
 
 
458 aa  43.5  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>