33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0437 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0437  putative DNA primase, small subunit  100 
 
 
312 aa  626  1e-178  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1683  DNA primase, small subunit  81.73 
 
 
312 aa  537  9.999999999999999e-153  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.773478 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0991  DNA primase small subunit  78.53 
 
 
312 aa  513  1e-144  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1787  putative DNA primase, small subunit  71.47 
 
 
312 aa  476  1e-133  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.057405 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1378  putative DNA primase, small subunit  42.57 
 
 
348 aa  246  4e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.214397  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0622  putative DNA primase, small subunit  33.33 
 
 
389 aa  165  8e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0953  DNA primase, small subunit  30.65 
 
 
378 aa  160  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1245  DNA primase, small subunit  44.32 
 
 
404 aa  144  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1955  putative DNA primase, small subunit  29.38 
 
 
374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.804448 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1793  DNA primase small subunit  35.04 
 
 
320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2019  DNA primase small subunit  31.36 
 
 
330 aa  140  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0420  DNA primase small subunit  40.56 
 
 
395 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.669616  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2047  putative DNA primase, small subunit  38.46 
 
 
387 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0066  DNA primase small subunit  27.15 
 
 
373 aa  125  7e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1303  DNA primase small subunit  40 
 
 
380 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1392  DNA primase small subunit  37.7 
 
 
390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1571  DNA primase small subunit  38.15 
 
 
414 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1132  DNA primase, small subunit, putative  38.3 
 
 
388 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0410  DNA primase, small subunit  36.26 
 
 
391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2564  DNA primase, small subunit  36.26 
 
 
391 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1798  DNA primase small subunit  33.17 
 
 
387 aa  113  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2753  DNA primase small subunit  29.73 
 
 
386 aa  109  7.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2482  DNA primase, small subunit  33.33 
 
 
392 aa  103  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0882  putative DNA primase, small subunit  26.6 
 
 
364 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506684  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1606  DNA primase small subunit  27.44 
 
 
357 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0877  DNA primase, small subunit  26.34 
 
 
357 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1070  putative DNA primase, small subunit  25.75 
 
 
363 aa  76.3  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1084  putative DNA primase, small subunit  24.92 
 
 
355 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.346262  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01650  conserved hypothetical protein  28 
 
 
429 aa  61.2  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55030  p48 polypeptide of DNA primase  28.29 
 
 
437 aa  57.4  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03033  DNA primase subunit Pri1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09020)  25.83 
 
 
521 aa  47  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.344659 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_48208  predicted protein  28.21 
 
 
398 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.180067 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41816  predicted protein  28.21 
 
 
398 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.251296 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>