23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE01650 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006687  CNE01650  conserved hypothetical protein  100 
 
 
429 aa  895    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03033  DNA primase subunit Pri1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09020)  46.35 
 
 
521 aa  416  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.344659 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55030  p48 polypeptide of DNA primase  41.67 
 
 
437 aa  343  2.9999999999999997e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54992  predicted protein  40 
 
 
458 aa  294  2e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030257  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_48208  predicted protein  42.31 
 
 
398 aa  280  4e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.180067 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41816  predicted protein  42.31 
 
 
398 aa  280  4e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.251296 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1787  putative DNA primase, small subunit  30.41 
 
 
312 aa  64.7  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.057405 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0991  DNA primase small subunit  27.07 
 
 
312 aa  63.2  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1683  DNA primase, small subunit  31.54 
 
 
312 aa  62  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.773478 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0437  putative DNA primase, small subunit  28 
 
 
312 aa  60.8  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1378  putative DNA primase, small subunit  28.88 
 
 
348 aa  60.5  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.214397  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1798  DNA primase small subunit  25.31 
 
 
387 aa  58.2  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2753  DNA primase small subunit  23.08 
 
 
386 aa  56.2  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2564  DNA primase, small subunit  24.92 
 
 
391 aa  54.3  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0622  putative DNA primase, small subunit  22.91 
 
 
389 aa  51.2  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2482  DNA primase, small subunit  24.31 
 
 
392 aa  49.7  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1070  putative DNA primase, small subunit  28.49 
 
 
363 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0877  DNA primase, small subunit  28.57 
 
 
357 aa  47  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0420  DNA primase small subunit  22.44 
 
 
395 aa  47  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.669616  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0882  putative DNA primase, small subunit  26.18 
 
 
364 aa  46.6  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506684  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0410  DNA primase, small subunit  22.1 
 
 
391 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1245  DNA primase, small subunit  21.29 
 
 
404 aa  46.6  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1571  DNA primase small subunit  22.22 
 
 
414 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>