29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1070 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1070  putative DNA primase, small subunit  100 
 
 
363 aa  743    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1606  DNA primase small subunit  92.01 
 
 
357 aa  682    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0877  DNA primase, small subunit  92.84 
 
 
357 aa  686    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1084  putative DNA primase, small subunit  74.17 
 
 
355 aa  557  1e-157  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.346262  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0882  putative DNA primase, small subunit  61.45 
 
 
364 aa  427  1e-118  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506684  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1392  DNA primase small subunit  28.74 
 
 
390 aa  93.2  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1571  DNA primase small subunit  27.45 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1378  putative DNA primase, small subunit  27.61 
 
 
348 aa  82.8  0.000000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.214397  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1303  DNA primase small subunit  23.56 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0622  putative DNA primase, small subunit  23.91 
 
 
389 aa  80.5  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1955  putative DNA primase, small subunit  24.26 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.804448 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2753  DNA primase small subunit  24.01 
 
 
386 aa  78.6  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1683  DNA primase, small subunit  26.92 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.773478 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1787  putative DNA primase, small subunit  25.68 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.057405 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2564  DNA primase, small subunit  24.86 
 
 
391 aa  71.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2482  DNA primase, small subunit  25.54 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0437  putative DNA primase, small subunit  26.39 
 
 
312 aa  70.1  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1798  DNA primase small subunit  24.06 
 
 
387 aa  69.7  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1245  DNA primase, small subunit  29.71 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2047  putative DNA primase, small subunit  21.19 
 
 
387 aa  66.6  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0953  DNA primase, small subunit  24.19 
 
 
378 aa  64.7  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0991  DNA primase small subunit  26.67 
 
 
312 aa  64.3  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1793  DNA primase small subunit  22.93 
 
 
320 aa  63.5  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0410  DNA primase, small subunit  22.82 
 
 
391 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0420  DNA primase small subunit  26.52 
 
 
395 aa  60.8  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.669616  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2019  DNA primase small subunit  25 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1132  DNA primase, small subunit, putative  21.47 
 
 
388 aa  57.4  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0066  DNA primase small subunit  20.87 
 
 
373 aa  53.5  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01650  conserved hypothetical protein  28.49 
 
 
429 aa  47.4  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>