33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2564 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0410  DNA primase, small subunit  87.98 
 
 		 391 aa  699    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2564  DNA primase, small subunit  100 
 
 		 391 aa  787    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2482  DNA primase, small subunit  71.43 
 
 		 392 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2753  DNA primase small subunit  65.05 
 
 		 386 aa  512  1e-144  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1798  DNA primase small subunit  57.65 
 
 		 387 aa  427  1e-118  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1392  DNA primase small subunit  38.29 
 
 		 390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0420  DNA primase small subunit  41.25 
 
 		 395 aa  263  3e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.669616  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1571  DNA primase small subunit  36.43 
 
 		 414 aa  249  8e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0953  DNA primase, small subunit  36.91 
 
 		 378 aa  237  3e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1303  DNA primase small subunit  37.41 
 
 		 380 aa  234  3e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2047  putative DNA primase, small subunit  37.78 
 
 		 387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1955  putative DNA primase, small subunit  34.16 
 
 		 374 aa  222  7e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.804448 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1245  DNA primase, small subunit  33.42 
 
 		 404 aa  220  3.9999999999999997e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1132  DNA primase, small subunit, putative  33.92 
 
 		 388 aa  199  5e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0622  putative DNA primase, small subunit  30.22 
 
 		 389 aa  157  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1378  putative DNA primase, small subunit  32.5 
 
 		 348 aa  147  3e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.214397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0991  DNA primase small subunit  38.6 
 
 		 312 aa  126  5e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1683  DNA primase, small subunit  36.9 
 
 		 312 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.773478 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0437  putative DNA primase, small subunit  36.26 
 
 		 312 aa  117  5e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1787  putative DNA primase, small subunit  34.5 
 
 		 312 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.057405 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2019  DNA primase small subunit  35.18 
 
 		 330 aa  102  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0066  DNA primase small subunit  23.17 
 
 		 373 aa  95.9  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1793  DNA primase small subunit  34.2 
 
 		 320 aa  86.3  8e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1070  putative DNA primase, small subunit  24.86 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0877  DNA primase, small subunit  23.73 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0882  putative DNA primase, small subunit  24.06 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506684  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1084  putative DNA primase, small subunit  24.35 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.346262  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1606  DNA primase small subunit  22.66 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_48208  predicted protein  23.9 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.180067 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41816  predicted protein  23.9 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.251296 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01650  conserved hypothetical protein  24.92 
 
 		 429 aa  54.3  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55030  p48 polypeptide of DNA primase  25.2 
 
 		 437 aa  51.6  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03033  DNA primase subunit Pri1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09020)  23.74 
 
 		 521 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.344659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>