28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2019 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2019  DNA primase small subunit  100 
 
 		 330 aa  681    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1793  DNA primase small subunit  52.13 
 
 		 320 aa  353  2e-96  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0622  putative DNA primase, small subunit  41.58 
 
 		 389 aa  182  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0991  DNA primase small subunit  39.62 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1683  DNA primase, small subunit  32.24 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.773478 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1787  putative DNA primase, small subunit  32.94 
 
 		 312 aa  147  3e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.057405 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0437  putative DNA primase, small subunit  31.36 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1378  putative DNA primase, small subunit  31.13 
 
 		 348 aa  137  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.214397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0420  DNA primase small subunit  31.25 
 
 		 395 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.669616  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1955  putative DNA primase, small subunit  27.03 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.804448 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1245  DNA primase, small subunit  33.98 
 
 		 404 aa  113  5e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2047  putative DNA primase, small subunit  34.25 
 
 		 387 aa  106  6e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0410  DNA primase, small subunit  34.67 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0066  DNA primase small subunit  29.5 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1392  DNA primase small subunit  32.64 
 
 		 390 aa  104  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2482  DNA primase, small subunit  32.65 
 
 		 392 aa  104  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2564  DNA primase, small subunit  35.18 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1798  DNA primase small subunit  33.5 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0953  DNA primase, small subunit  32.31 
 
 		 378 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2753  DNA primase small subunit  32.66 
 
 		 386 aa  99.4  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1571  DNA primase small subunit  33.33 
 
 		 414 aa  95.5  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1132  DNA primase, small subunit, putative  31.4 
 
 		 388 aa  94.7  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1303  DNA primase small subunit  30.25 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0882  putative DNA primase, small subunit  25.08 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506684  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1070  putative DNA primase, small subunit  25 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1084  putative DNA primase, small subunit  25.57 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.346262  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0877  DNA primase, small subunit  25 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1606  DNA primase small subunit  24.01 
 
 		 357 aa  55.8  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>