28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1606 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0877  DNA primase, small subunit  95.52 
 
 		 357 aa  704    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1070  putative DNA primase, small subunit  92.01 
 
 		 363 aa  682    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1606  DNA primase small subunit  100 
 
 		 357 aa  730    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1084  putative DNA primase, small subunit  76.69 
 
 		 355 aa  568  1e-161  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.346262  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0882  putative DNA primase, small subunit  63.64 
 
 		 364 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506684  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1392  DNA primase small subunit  28.05 
 
 		 390 aa  91.3  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1378  putative DNA primase, small subunit  28.77 
 
 		 348 aa  90.1  5e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.214397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1571  DNA primase small subunit  25.72 
 
 		 414 aa  89.7  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1303  DNA primase small subunit  23.44 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1955  putative DNA primase, small subunit  23.62 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.804448 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2753  DNA primase small subunit  24.41 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1245  DNA primase, small subunit  26.49 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1787  putative DNA primase, small subunit  29.13 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.057405 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1683  DNA primase, small subunit  26.56 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.773478 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0622  putative DNA primase, small subunit  24.17 
 
 		 389 aa  79.3  0.00000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0953  DNA primase, small subunit  22.89 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0437  putative DNA primase, small subunit  27.44 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2482  DNA primase, small subunit  25.08 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1798  DNA primase small subunit  24.21 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0991  DNA primase small subunit  27 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2047  putative DNA primase, small subunit  20.2 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0420  DNA primase small subunit  25.93 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.669616  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2564  DNA primase, small subunit  22.66 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0066  DNA primase small subunit  22.86 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1793  DNA primase small subunit  23.05 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0410  DNA primase, small subunit  22.51 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1132  DNA primase, small subunit, putative  22.79 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2019  DNA primase small subunit  24.01 
 
 		 330 aa  55.8  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>