28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1955 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1955  putative DNA primase, small subunit  100 
 
 		 374 aa  764    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.804448 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0953  DNA primase, small subunit  57.71 
 
 		 378 aa  461  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2047  putative DNA primase, small subunit  56.01 
 
 		 387 aa  441  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1132  DNA primase, small subunit, putative  51.05 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1303  DNA primase small subunit  49.6 
 
 		 380 aa  374  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0420  DNA primase small subunit  39.8 
 
 		 395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.669616  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1392  DNA primase small subunit  40.25 
 
 		 390 aa  264  2e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1571  DNA primase small subunit  39.22 
 
 		 414 aa  262  8e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1798  DNA primase small subunit  36.87 
 
 		 387 aa  228  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2753  DNA primase small subunit  35.11 
 
 		 386 aa  226  7e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2564  DNA primase, small subunit  34.16 
 
 		 391 aa  222  7e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0410  DNA primase, small subunit  34.57 
 
 		 391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2482  DNA primase, small subunit  34.75 
 
 		 392 aa  219  5e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1245  DNA primase, small subunit  33.75 
 
 		 404 aa  202  6e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0622  putative DNA primase, small subunit  30.54 
 
 		 389 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0991  DNA primase small subunit  31 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0066  DNA primase small subunit  28.16 
 
 		 373 aa  142  9e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1683  DNA primase, small subunit  30.46 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.773478 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1378  putative DNA primase, small subunit  29.59 
 
 		 348 aa  127  3e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.214397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0437  putative DNA primase, small subunit  38.64 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1787  putative DNA primase, small subunit  39.77 
 
 		 312 aa  125  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.057405 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2019  DNA primase small subunit  27.03 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1793  DNA primase small subunit  31 
 
 		 320 aa  87.8  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0877  DNA primase, small subunit  23.74 
 
 		 357 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1606  DNA primase small subunit  23.62 
 
 		 357 aa  83.2  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1084  putative DNA primase, small subunit  24.08 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.346262  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1070  putative DNA primase, small subunit  24.26 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0882  putative DNA primase, small subunit  22.92 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>