28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1793 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1793  DNA primase small subunit  100 
 
 		 320 aa  657    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2019  DNA primase small subunit  52.13 
 
 		 330 aa  353  2e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0622  putative DNA primase, small subunit  33.44 
 
 		 389 aa  149  8e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0991  DNA primase small subunit  37.04 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1683  DNA primase, small subunit  36.84 
 
 		 312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.773478 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0437  putative DNA primase, small subunit  35.04 
 
 		 312 aa  139  8.999999999999999e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1787  putative DNA primase, small subunit  33.33 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.057405 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1378  putative DNA primase, small subunit  29.02 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.214397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1245  DNA primase, small subunit  31.25 
 
 		 404 aa  106  4e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0066  DNA primase small subunit  27.57 
 
 		 373 aa  105  8e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0420  DNA primase small subunit  33.91 
 
 		 395 aa  96.3  6e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.669616  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0410  DNA primase, small subunit  34.2 
 
 		 391 aa  91.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2482  DNA primase, small subunit  35.38 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2753  DNA primase small subunit  32.89 
 
 		 386 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1798  DNA primase small subunit  35.45 
 
 		 387 aa  91.3  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0953  DNA primase, small subunit  32.11 
 
 		 378 aa  90.5  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2047  putative DNA primase, small subunit  34.65 
 
 		 387 aa  90.1  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1955  putative DNA primase, small subunit  31 
 
 		 374 aa  87.8  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.804448 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2564  DNA primase, small subunit  34.2 
 
 		 391 aa  86.3  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1571  DNA primase small subunit  31.71 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1392  DNA primase small subunit  29.26 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1132  DNA primase, small subunit, putative  30.2 
 
 		 388 aa  75.9  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1303  DNA primase small subunit  31.16 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0882  putative DNA primase, small subunit  22.82 
 
 		 364 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506684  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1070  putative DNA primase, small subunit  22.93 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1084  putative DNA primase, small subunit  23.41 
 
 		 355 aa  62.4  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.346262  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0877  DNA primase, small subunit  22.73 
 
 		 357 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1606  DNA primase small subunit  23.05 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>