34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1303 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1303  DNA primase small subunit  100 
 
 		 380 aa  786    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2047  putative DNA primase, small subunit  52.53 
 
 		 387 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0953  DNA primase, small subunit  51.05 
 
 		 378 aa  402  1e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1955  putative DNA primase, small subunit  49.6 
 
 		 374 aa  374  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.804448 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1132  DNA primase, small subunit, putative  48.06 
 
 		 388 aa  350  2e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1392  DNA primase small subunit  39.15 
 
 		 390 aa  259  4e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0420  DNA primase small subunit  39.21 
 
 		 395 aa  255  8e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.669616  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2753  DNA primase small subunit  38.25 
 
 		 386 aa  248  1e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1571  DNA primase small subunit  38.63 
 
 		 414 aa  247  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0410  DNA primase, small subunit  37.91 
 
 		 391 aa  239  6.999999999999999e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2564  DNA primase, small subunit  37.41 
 
 		 391 aa  234  3e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1798  DNA primase small subunit  36.5 
 
 		 387 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2482  DNA primase, small subunit  34.73 
 
 		 392 aa  219  7e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1245  DNA primase, small subunit  34.77 
 
 		 404 aa  193  5e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0622  putative DNA primase, small subunit  28.87 
 
 		 389 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0991  DNA primase small subunit  34 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0437  putative DNA primase, small subunit  40 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1378  putative DNA primase, small subunit  27.32 
 
 		 348 aa  120  4.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.214397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1787  putative DNA primase, small subunit  41.82 
 
 		 312 aa  119  6e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.057405 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1683  DNA primase, small subunit  29.38 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.773478 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0066  DNA primase small subunit  24.77 
 
 		 373 aa  106  7e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1084  putative DNA primase, small subunit  27.17 
 
 		 355 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.346262  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1606  DNA primase small subunit  23.44 
 
 		 357 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1070  putative DNA primase, small subunit  23.56 
 
 		 363 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0877  DNA primase, small subunit  23.18 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0882  putative DNA primase, small subunit  25.94 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506684  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2019  DNA primase small subunit  30.25 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1793  DNA primase small subunit  31.16 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6073  DNA ligase D  30.11 
 
 		 927 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6483  ATP dependent DNA ligase  30.11 
 
 		 936 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1346  ATP dependent DNA ligase  30.11 
 
 		 936 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.893044  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5610  ATP dependent DNA ligase  29.55 
 
 		 932 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5476  DNA ligase D  28.41 
 
 		 927 aa  43.1  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388357 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6340  DNA ligase D  28.98 
 
 		 949 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.15116 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>