31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0622 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0622  putative DNA primase, small subunit  100 
 
 
389 aa  806    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0420  DNA primase small subunit  35.17 
 
 
395 aa  208  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.669616  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1392  DNA primase small subunit  34.13 
 
 
390 aa  206  7e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2019  DNA primase small subunit  41.58 
 
 
330 aa  197  3e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2047  putative DNA primase, small subunit  31.19 
 
 
387 aa  195  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0953  DNA primase, small subunit  32.45 
 
 
378 aa  190  4e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1571  DNA primase small subunit  31.18 
 
 
414 aa  189  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1378  putative DNA primase, small subunit  34.13 
 
 
348 aa  189  1e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.214397  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1798  DNA primase small subunit  30.43 
 
 
387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1132  DNA primase, small subunit, putative  30.84 
 
 
388 aa  182  7e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1955  putative DNA primase, small subunit  30.54 
 
 
374 aa  182  7e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.804448 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0991  DNA primase small subunit  33.42 
 
 
312 aa  179  4.999999999999999e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1245  DNA primase, small subunit  29.77 
 
 
404 aa  179  8e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0437  putative DNA primase, small subunit  32.09 
 
 
312 aa  178  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0066  DNA primase small subunit  31.32 
 
 
373 aa  177  3e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2753  DNA primase small subunit  28.4 
 
 
386 aa  176  9e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0410  DNA primase, small subunit  30.46 
 
 
391 aa  175  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1683  DNA primase, small subunit  33.7 
 
 
312 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.773478 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1787  putative DNA primase, small subunit  34.89 
 
 
312 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.057405 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2564  DNA primase, small subunit  30.22 
 
 
391 aa  169  8e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1303  DNA primase small subunit  28.87 
 
 
380 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1793  DNA primase small subunit  33.44 
 
 
320 aa  164  3e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2482  DNA primase, small subunit  30.47 
 
 
392 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0877  DNA primase, small subunit  24.71 
 
 
357 aa  97.1  5e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1084  putative DNA primase, small subunit  23.4 
 
 
355 aa  93.6  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.346262  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1070  putative DNA primase, small subunit  23.91 
 
 
363 aa  92  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1606  DNA primase small subunit  24.17 
 
 
357 aa  90.9  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0882  putative DNA primase, small subunit  22.63 
 
 
364 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506684  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01650  conserved hypothetical protein  22.91 
 
 
429 aa  53.9  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54992  predicted protein  23.78 
 
 
458 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030257  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55030  p48 polypeptide of DNA primase  23.47 
 
 
437 aa  43.1  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>