34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2753 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2753  DNA primase small subunit  100 
 
 
386 aa  775    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0410  DNA primase, small subunit  65.82 
 
 
391 aa  520  1e-146  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2482  DNA primase, small subunit  65.14 
 
 
392 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2564  DNA primase, small subunit  65.05 
 
 
391 aa  512  1e-144  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1798  DNA primase small subunit  60.88 
 
 
387 aa  484  1e-136  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1392  DNA primase small subunit  37.88 
 
 
390 aa  271  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0420  DNA primase small subunit  41.25 
 
 
395 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.669616  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1303  DNA primase small subunit  38.25 
 
 
380 aa  248  1e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1571  DNA primase small subunit  35.99 
 
 
414 aa  236  7e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2047  putative DNA primase, small subunit  37.75 
 
 
387 aa  233  6e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1955  putative DNA primase, small subunit  35.11 
 
 
374 aa  226  8e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.804448 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0953  DNA primase, small subunit  35.9 
 
 
378 aa  224  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1245  DNA primase, small subunit  32.42 
 
 
404 aa  222  8e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1132  DNA primase, small subunit, putative  35.77 
 
 
388 aa  218  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0622  putative DNA primase, small subunit  28.4 
 
 
389 aa  164  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1378  putative DNA primase, small subunit  34.39 
 
 
348 aa  150  3e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.214397  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1683  DNA primase, small subunit  28.61 
 
 
312 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.773478 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0991  DNA primase small subunit  36.05 
 
 
312 aa  123  7e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1787  putative DNA primase, small subunit  31.58 
 
 
312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.057405 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0437  putative DNA primase, small subunit  30.41 
 
 
312 aa  107  5e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0066  DNA primase small subunit  25.54 
 
 
373 aa  105  9e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2019  DNA primase small subunit  32.66 
 
 
330 aa  99.4  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1793  DNA primase small subunit  32.89 
 
 
320 aa  91.7  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1606  DNA primase small subunit  24.41 
 
 
357 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0877  DNA primase, small subunit  24.4 
 
 
357 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1070  putative DNA primase, small subunit  24.01 
 
 
363 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1084  putative DNA primase, small subunit  24.53 
 
 
355 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.346262  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0882  putative DNA primase, small subunit  25.85 
 
 
364 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506684  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_48208  predicted protein  23.81 
 
 
398 aa  60.5  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.180067 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41816  predicted protein  23.81 
 
 
398 aa  60.5  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.251296 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01650  conserved hypothetical protein  23.08 
 
 
429 aa  56.2  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03033  DNA primase subunit Pri1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09020)  23.08 
 
 
521 aa  50.1  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.344659 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55030  p48 polypeptide of DNA primase  25.87 
 
 
437 aa  47  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54992  predicted protein  24.23 
 
 
458 aa  46.2  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>