30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0882 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0882  putative DNA primase, small subunit  100 
 
 
364 aa  745    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506684  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1606  DNA primase small subunit  63.56 
 
 
357 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1084  putative DNA primase, small subunit  62.71 
 
 
355 aa  442  1e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.346262  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0877  DNA primase, small subunit  61.69 
 
 
357 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1070  putative DNA primase, small subunit  61.39 
 
 
363 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1787  putative DNA primase, small subunit  27.4 
 
 
312 aa  92  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.057405 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1571  DNA primase small subunit  24.53 
 
 
414 aa  83.2  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2047  putative DNA primase, small subunit  23.48 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1303  DNA primase small subunit  25.94 
 
 
380 aa  80.9  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1683  DNA primase, small subunit  26.75 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.773478 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0437  putative DNA primase, small subunit  26.79 
 
 
312 aa  79.7  0.00000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1378  putative DNA primase, small subunit  28.57 
 
 
348 aa  77  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.214397  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1955  putative DNA primase, small subunit  22.98 
 
 
374 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.804448 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1392  DNA primase small subunit  25.33 
 
 
390 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2753  DNA primase small subunit  26.3 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1132  DNA primase, small subunit, putative  21.64 
 
 
388 aa  73.2  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0953  DNA primase, small subunit  23.28 
 
 
378 aa  72.8  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0991  DNA primase small subunit  25.53 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0622  putative DNA primase, small subunit  22.94 
 
 
389 aa  70.9  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0410  DNA primase, small subunit  22.73 
 
 
391 aa  70.1  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2482  DNA primase, small subunit  22.9 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2019  DNA primase small subunit  25.08 
 
 
330 aa  68.9  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1245  DNA primase, small subunit  29.73 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1793  DNA primase small subunit  22.82 
 
 
320 aa  65.9  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2564  DNA primase, small subunit  24.06 
 
 
391 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1798  DNA primase small subunit  23.29 
 
 
387 aa  60.5  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54992  predicted protein  23.86 
 
 
458 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030257  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0420  DNA primase small subunit  23.4 
 
 
395 aa  52.4  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.669616  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01650  conserved hypothetical protein  26.18 
 
 
429 aa  47  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0066  DNA primase small subunit  20.25 
 
 
373 aa  46.6  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>