33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3643 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3643  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 180 aa  352  1e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.143089 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4469  hypothetical protein  59.06 
 
 		 179 aa  194  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0114  hypothetical protein  55.37 
 
 		 191 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5901  hypothetical protein  58.43 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.106245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0962  hypothetical protein  59.6 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0207  hypothetical protein  53.57 
 
 		 177 aa  175  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0235844  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0399  hypothetical protein  58.23 
 
 		 174 aa  173  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5108  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  59.6 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1066  hypothetical protein  56.95 
 
 		 179 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1533  hypothetical protein  49.67 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0993854  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1249  hypothetical protein  49.67 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.417761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0601  hypothetical protein  40.65 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1396  hypothetical protein  40.91 
 
 		 179 aa  99.4  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120988  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47120  hypothetical protein  38.36 
 
 		 198 aa  91.3  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.244366  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01660  hypothetical protein  39.39 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1577  hypothetical protein  39.29 
 
 		 189 aa  86.3  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488602  normal  0.478863 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1407  hypothetical protein  41.72 
 
 		 216 aa  85.5  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1448  hypothetical protein  40.12 
 
 		 191 aa  84.7  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056877 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0257  hypothetical protein  35.42 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01530  hypothetical protein  38.71 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5886  hypothetical protein  32.14 
 
 		 161 aa  72  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171898  normal  0.580302 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1192  hypothetical protein  31.33 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1476  hypothetical protein  31.33 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0126  hypothetical protein  31.21 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7735  tetratricopeptide TPR_2  33.1 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2634  hypothetical protein  24.29 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2402  hypothetical protein  29.37 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0582691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0449  hypothetical protein  25 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2103  hypothetical protein  26.71 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000113026 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2318  tetratricopeptide TPR_2  36.09 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00165339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3525  hypothetical protein  26.73 
 
 		 165 aa  45.1  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00689073 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3662  hypothetical protein  21.71 
 
 		 161 aa  44.7  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.726286  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1097  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 409 aa  43.1  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0987806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>