24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2402 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2402  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  342  1e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0582691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3525  hypothetical protein  72.39 
 
 		 165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00689073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5886  hypothetical protein  53.46 
 
 		 161 aa  157  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171898  normal  0.580302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0126  hypothetical protein  55.21 
 
 		 159 aa  154  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0257  hypothetical protein  37.42 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1476  hypothetical protein  37.09 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1192  hypothetical protein  37.09 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7735  tetratricopeptide TPR_2  36.55 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5108  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.29 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1533  hypothetical protein  33.06 
 
 		 169 aa  67.4  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0993854  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1249  hypothetical protein  33.06 
 
 		 169 aa  67.4  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.417761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0962  hypothetical protein  34.53 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1066  hypothetical protein  35.59 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2318  tetratricopeptide TPR_2  40.19 
 
 		 159 aa  62  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00165339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4469  hypothetical protein  30 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1396  hypothetical protein  29.22 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120988  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0399  hypothetical protein  28.06 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0207  hypothetical protein  31.71 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0235844  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0114  hypothetical protein  28.17 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5901  hypothetical protein  27.46 
 
 		 177 aa  50.8  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.106245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3643  tetratricopeptide TPR_2  29.09 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.143089 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1577  hypothetical protein  26.67 
 
 		 189 aa  48.1  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488602  normal  0.478863 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0601  hypothetical protein  26.71 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1407  hypothetical protein  27.33 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>