32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0114 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0114  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  387  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5901  hypothetical protein  67.48 
 
 		 177 aa  231  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.106245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0399  hypothetical protein  67.72 
 
 		 174 aa  215  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5108  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  66.89 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4469  hypothetical protein  60 
 
 		 179 aa  198  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0962  hypothetical protein  64.9 
 
 		 179 aa  197  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0207  hypothetical protein  58.48 
 
 		 177 aa  191  6e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0235844  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1066  hypothetical protein  61.59 
 
 		 179 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3643  tetratricopeptide TPR_2  55.37 
 
 		 180 aa  176  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.143089 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1533  hypothetical protein  50.98 
 
 		 169 aa  153  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0993854  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1249  hypothetical protein  50.98 
 
 		 169 aa  153  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.417761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0601  hypothetical protein  40.12 
 
 		 168 aa  124  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01660  hypothetical protein  46.77 
 
 		 179 aa  101  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1407  hypothetical protein  42.07 
 
 		 216 aa  99  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1448  hypothetical protein  42.33 
 
 		 191 aa  94.7  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056877 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0257  hypothetical protein  38.46 
 
 		 162 aa  90.1  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1577  hypothetical protein  41.67 
 
 		 189 aa  90.1  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488602  normal  0.478863 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3662  hypothetical protein  29.61 
 
 		 161 aa  87  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.726286  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1396  hypothetical protein  36.99 
 
 		 179 aa  84.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120988  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47120  hypothetical protein  37.16 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.244366  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0449  hypothetical protein  27.81 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7735  tetratricopeptide TPR_2  32.63 
 
 		 161 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2103  hypothetical protein  30.46 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000113026 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2634  hypothetical protein  25.83 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5886  hypothetical protein  32.62 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171898  normal  0.580302 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1192  hypothetical protein  29.68 
 
 		 164 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1476  hypothetical protein  29.68 
 
 		 164 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2402  hypothetical protein  28.17 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0582691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0126  hypothetical protein  30.14 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01530  hypothetical protein  30.43 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2318  tetratricopeptide TPR_2  35.37 
 
 		 159 aa  48.9  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00165339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3525  hypothetical protein  27.78 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00689073 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>